Yu Kitago

【お知らせ】第19回高校生のための蛋白研セミナーを開催します。 開催日：2026/5/2(土) 場所：大阪大学（吹田キャンパス）蛋白質研究所１階講堂 詳細及び事前登録（3/16 9:00受付開始）はこちらから↓ protein.osaka-u.ac.jp/seminar/202603… #阪大 #蛋白研 #高校生向けセミナー #高校生

放射光実験の大容量データの即時圧縮技術を開発 －SPring-8のデータを8,600分の１に圧縮－（プレスリリース） — SPring-8 Web Site spring8.or.jp/ja/news_public… #SPring8

教授が４ヶ月間研究熱心でない大学院生の修論に手を入れてようやっと完成させる→大学院生は合格→共著で学術雑誌に投稿を持ちかける→必要以上に力添えされたと見られるのが嫌という大学院生側のチンケなプライドのせいで頓挫→仕方無く教授が単著で投稿→処分、ってさすがに酷いだろう。これで処分って、研究の主要な部分をしっかり指導して一緒に出した業績でも、大学院生が共著での投稿を拒否したら永久に投稿論文として残せないってことだよね。まあ、修論の大半を教授が書かないと修了できないような大学院生に対しては、そこまで手出しせず自力である程度やらせて不合格にする方が筋は通っているわけで、下手に情けをかけたのが間違いっちゃー間違いだけど。まあ、今後は修論の内容の投稿については、明らかな間違いや瑕疵がない限り内容を共著でジャーナルに投稿することに同意する、という念書を最初にとってから指導を始めるとかですかね。

あれ？v3.2.2でもImage > ModeにCMYK無いけど… #GIMP

そもそもCMYKがサポートされたのか

PyMOL-RS zmactep.github.io/pymol-rs/ Rustで作り直したPyMOL Cootのスプラッシュもそうなんだけど、なぜ構造生物学業界の分子viewerには当然のようにDOOMネタが多いのか 「はい、もちろんDOOMも動かせますよ(ﾆｺﾆｺ」

アメリカ人の友達にコレが火鉢だよって教えたらビックリしてたよね。なんなら”違う！”って否定された。

ふと hosts 開いたら Adobe がなんか追加してた。ここに勝手に書くのはEVILすぎるだろ…… 2週間くらいくらい前から言及されてるっぽい？

FEI (Thermo Fisher)の初期型のVitrobotを譲渡します．二週間後に廃棄します．部品が不足してるために稼働しませんが，あまり使われていないので部品どりには使えそうです．メールかDMをください．拡散希望です．#大阪公立大学 #クライオ電子顕微鏡 #Vitrobot

@kurageNYC そういうとこあんまり優しくないってアメリカあるあるなんですかね？？もう5年近くになりますけど，いまだにわからないことが出てきては誰に聞いてもイマイチ要領を得ず，結局なんとか自分で調べてやっと解決ってのを繰り返してる気がします…仕事でもプライベートでも…

振られてくる仕事内容が(どころか何を言っているのかすら全く)分からないので色々な人に聞いたけど、既読無視されまくって何も進まなかったよね。😇

メリケンあるある

validation graphsを表示させて置こうとするとグラフ下部の残基番号が見切れててわからない…その中のラマチャンドラン(棒グラフ)と別に表示させているプロットと，随分値が違うように見えるんだけど？？

#coot v1.1.x-pre #Ubuntu 24.04 ラマチャンドランを表示しておいてもフォーカスしてる残基がハイライトされない？？0.9ではされたはず．それと別ウインドウにも出せるようにして欲しい…

ホントだ．Unit Cellは表示されるけど，対称分子が描画されない…

RSR Refine (Shift + R)したらpolypeptide chainがバラバラになってしまう。アカン。なんでや。

解決しました。いつの間にかドメインが変わっていたらしい。。。SNSのリンクとか諸々修正。

ドイツ政府がODFを標準フォーマットに指定しました！ blog.documentfoundation.org/blog/2026/03/2…

Protein modificationの最近の動向をまとめた総説 sciencedirect.com/science/articl… こちらも、よく整理されたトレンド把握用の総説ですね。 興味深いのは protein modification を軸に ADC、cytokine、proximity-enabled covalent therapeutics を一つの流れで見せた点ですね。 ここ2年程度の文献を集めて、site-specific modification、glycan engineering、genetic code expansion、linker/payload の多様化を議論しています。 一方で、広く拾っている分、各論の深さにはかなり差があります。例えばADC では conjugation chemistry、glycan remodeling、noncanonical amino acid 導入まで比較的厚く取り扱っていますが、CMC、developability、analytical development、DARと PK の関係、payload catabolite の挙動といった実装上の論点はあまりカバーしていません。つまり、研究動向のマップとしてはよいが、ADC 開発実務のレビューとして読むと物足りなく、他で保管する必要あり　という理解でいます。

メリカの皆さん！今週のWeeeeeeee！は刺身祭りらしいですよ！

確か会場設営バイトで一回行ったな…20年以上前だけど