はいぶり🧬

今年度はバクテリアでのpETシステムのような従来の遺伝子工学的なベクターデザインからバイオブリックパーツなどの合成生物学的なベクターデザインへのパラダイムシフトをいろんな方へと提供するための企画化生物学に向けたサイエンスを遂行していきます。

結構しんどい、、、前期耐えられるか

今講義が週一回のみだけど

@NA_Kyoto_U おめでとう御座います！

創発的研究支援事業の2025年度新規採択課題に選んでいただきました 破壊的イノベーション目指して頑張ります🫠 jst.go.jp/souhatsu/call/…

【メンバー紹介】広報担当M1 植物由来医薬品原料を大腸菌に作らせる研究をしてます🧪✨ 博士進学予定で、いまは学振の申請書に苦しんでいます、、私立大学なので周りに博士学生が少なく、心配でしたがコミュニティに参加することで先輩方から情報やアドバイスを得ることができています⤴️

【メンバー紹介】web担当D1 遺伝子回路の研究をしています。大腸菌の遺伝子発現をシステマティックに制御することを目的としています。 趣味は遺伝子発現立ち上がりのタイムコース（徹夜）です。 よろしくお願いします。

いややばそうや予感だね

これやばい

Genome editing of phylogenetically distinct bacteria using cross-species retron-mediated recombineering go.nature.com/4tZluOU

本当にこの通りで、サイクルにもってけないと詰む。 そして大学院という就活予備校が出来上がる。

D2宮崎君 (@tomo_lul) の論文が @NatureChemistry に掲載されました！🥳 名古屋大学村上研究室との共同研究で、光で結合と解離をスイッチングできる完全人工の小分子とタンパク質のペアをゼロから創り出す手法を開発しました。 nature.com/articles/s4155…

こういう論文のデータ本当に欲しかったので、このタイミングで出会うのが奇跡だ

やば、これちょうど欲しかったソースデータだ そう、コドン最適化においてレアコドンが邪魔者って思われがちなんだけど、翻訳過程の折りたたみの時間を与えるためにあえてレアコドンを利用してその時間を作ってあげたりとか、N末のRNA二字構造とか結構大事なんよね

この1ヶ月半程度ずっと、AI for Scienceの活動をしていて、僕の設計思想のもと合成生物学パーツに纏わる非常にいい予測と創作ツールをぽんぽん作ることができました。本年度は自分たちで予測したデザイン配列から合成、ワークまでぽんぽん作っていき面白い仕事をしていきます

同義置換でもタンパク質折りたたみに影響 タンパク質の折りたたみエラーを検知するアッセイ系を用い、アミノ酸に変化がない同義置換でもタンパク質折りたたみに影響することを報告。レアコドンはむしろ折りたたみ効率を向上させるらしい。N末端や二次構造境界が特に大事とか cell.com/cell-reports/f…

@SI_Hachisuka おめでとう御座います！

ごあいさつ｜Hachisuka note.com/mmf_lab/n/n0a0…

生物系サークルでiGEMっていうやつがあるけど、入らない方がいいよ 研究室訪問とか研究室バイトで普通に研究始めよう

今年は博士に行く学生が任期付き助手に採択されたので、生活の面でも安定でサイエンスに集中できる体制が整えてよかった、来年も博士に行く学生がおるので、なんとかこの辺りこちらでもサポートしてあげたい、まあ、来年上がる学生はうまく優秀だからあまり心配して無いけど、、、

今年は4年目学生も一周回っていろいろ見えてきたものがある。個人的に感じたのはラボ配属説明ではラボのスタイル崩さず学生には媚びずにこちらの意向を伝える。人気投票でもなく、ミスマッチを避けるためのものだから、じゃないとお互い不幸になる

なんのために大学院に行くのだろうという事象をよく見るし、当事者でもあるが、解決策は見出せず。院生の多くは就活予備校と化しているがこれは止められないし、個人の意識、自覚の問題なんだろな。うちではそうならないように自覚を持った方を育てたいし、そういう人間形成教育をするしかないんやろな

最初アップルのサブスクでやってたんだけどバカらしくなってカードで支払いたい。けどいまだに拒否されるのなんでだろう、、、