北大光生物学研究室

北大院・生物情報解析科学研究室のTwitterアカウントを開設しました。研究室に関連した出来事を発信していきます。 私たちは、微生物ロドプシンという膜タンパク質を研究しています。 #微生物ロドプシン

塚本卓助教、須藤未羽さんらによるアニオンチャネルロドプシンの論文が公開されました。ゲート閉鎖時の分子内イベントをH+移動反応に注目して解析。名工大の古谷祐詞先生、伊藤侑真さん、神取秀樹先生との共同研究成果です。皆様に深く感謝いたします。sciencedirect.com/science/articl…

塚本卓助教、大竹崚平君、近藤香織さん、中野隼佑君らによるプロトンポンプ型ロドプシン（H+ pump）の論文が公開されました。異なる温度環境に生息するバクテリア由来H+ pumpの光反応を熱力学的に解析し、温度適応戦略の一端を明らかにしています。皆さん、お疲れ様でした！pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…

今年度の卒論と修論の発表会が無事終了し、うちの研究室からは、B4の白川深愛さんが優秀発表賞をいただきました。白川さん、おめでとう！発表をお聴きいただいた皆様、大変有難うございました。他のメンバーもとても良い発表でした！お疲れ様でした。

Surface Density-Dependent Interactions between Photoactivated Sensory Rhodopsin 2 and Its Transducer | ACS Omega pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…

@Rhodopsinist_YS こちらこそ、どうも有難うございました。また飲みいきましょう！

🎉おめでとうございます＆共著に加えていただきありがとうございます。

瀋さん、秋田君、和田君、江口さんらが担当した論文です。イオン輸送型ロドプシンは無機イオンのみを膜輸送すると考えられてきましたが、Cl-ポンプの一部がベンゼン環やアルキル鎖を持つ有機イオンをも輸送することを初めて示しました。光駆動型有機イオンポンプの発見です！pubs.acs.org/doi/full/10.10…

翟郁博くんと下坂杏奈さんが担当したCl-ポンプロドプシンの論文が公開されました。Cl-は過渡的な水和チャネルを透過します。周囲の疎水性残基は、Cl-と相互作用しないものの、綺麗な水和チャネル形成に必須であり、置換するとCl-透過が100倍以上遅くなることを示しました。 jbc.org/article/S0021-…

佐賀大学・藤澤知績先生、海野雅司先生らとの共同研究論文が公開になりました。シアノバクテリアのCl-ポンプを低温ラマン散乱により解析し、放出中間体を同定した上で、これまでよりも少ない中間体によって、光反応を記述できることを示しました。共同研究に感謝致します。pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…

"Restoring vision with optogenetics" in Nature👁️🧬 nature.com/articles/d4158… @Nature

今年度の卒論発表会と修論発表会が無事終了し、弊研究室からは、M2の篠根司君と長谷川快篤君が優秀発表賞を受賞しました！２名も表彰されるなんて、とても光栄です！４年生の２名も大変良い発表でした！お聞き頂いた皆様、大変有難うございました。

佐賀大学・藤澤知績先生、海野雅司先生との共同研究論文がJPCBから公開になりました。シアノバクテリアのCl- pump (MrHR)の光反応を低温における過渡共鳴ラマン散乱によって観測し、レチナールの構造変化とCl-輸送ステップの関係を明らかにしました。共同研究に感謝します。 pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…

卒業生の石塚くんが筆頭著者の、新しいCl-ポンプ型ロドプシンに関する論文がJ. Biol. Chem.に掲載されました！🎉おめでとうございます！🥳(1/2) jbc.org/article/S0021-… @jbiolchem

京都工繊大の松尾和哉先生、北大電子研の玉置信之先生らとの共同研究論文が公開されました。染色体輸送モーター蛋白質CENP-Eの活性を、青緑光のON/OFFだけで制御できる阻害剤を開発し、生細胞中で光の効果を確認されています。菊川は熱異性化速度の決定をお手伝いしました。pubs.rsc.org/en/content/art…

塚本卓助教、近藤香織さん、大竹崚平君、中野隼佑君らによるProteorhodopsin（PR）の論文が公開になりました。南極のバクテリアを試料に、PRが細胞の光応答に貢献する様子や、PR自身の性質を調べた内容です。北大・低温研の先生方との共同研究です。有難うございました。pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…

濱田君が担当してくれたCl- pump rhodopsinの論文が、J. Biol. Chem.から公開されました。イオン選択膜で調べたところ、新たなCl-結合サイトが見つかり、輸送経路も予想できたという内容です。濱田君、おめでとう！jbc.org/article/S0021-…

生物物理誌の最新号が公開されました。今回は名工大・神取研の細島先生によるH+輸送型のヘリオロドプシンの発見に関するご研究と、阪大・水谷先生による内向きH+ポンプのシゾロドプシンのRaman分光研究といった、2つのロドプシンに関する記事が掲載されています！(1/2) biophys.jp/journal/journa…

"Heliorhodopsin-mediated light-modulation of ABC transporter" by Prof. Jung and his team. Congratulations! nature.com/articles/s4146…

"Theoretical prediction of broadband ambient light optogenetic vision restoration with ChRmine and its mutants” by Prof. Sukhdev Roy and his team. Congratulations! nature.com/articles/s4159…

今年度の卒論と修論発表会が無事終わり、慰労会で表彰式がありました。弊研究室からは、大木優也君（修論発表 優秀賞）、和田丈司君（卒研発表 最優秀賞）、小川遥己さん（学科成績最優秀賞）が表彰されました。他のメンバーも本当に良い発表でした。お聞き頂いた皆様、大変有難うございました。

佐賀大学・藤澤知績先生、海野雅司先生との共同研究論文が、J. Phys. Chem. Lett.に掲載されました。過渡共鳴ラマン散乱によって、Na+ポンプロドプシンのレチナール再異性化過程を詳細に解析しました。共同研究に感謝致します。pubs.acs.org/doi/full/10.10…