Joon An

@V_nDing_machine 하면 조금 기분이 좋아집니다 ㅎㅎ 어느정도 하다가, 대쉬보드 만들어줘~ 하면 해줘요. 저는 토픽별로 만들어서 놀고 있습니다 ㅎ

다른분들은 llm wiki 프론트 엔드를 따로작업하시는걸까

에이전트로 1인 랩이 된다면 빠른 은퇴가 가능할지도.. 예전엔 박사를 하면서 지도교수에게 독립하기 위해 노력했다면... 이제는 교수가 되어 학생들로부터 독립하기 노력해야하는듯? 독립을 위한 작업들이 하나 둘씩 연습이 되는것 같은데.. 클라우드로 작업만 잡아두면 1인 랩이 진짜 가능할지도?

@mahler83 사실 그냥 해보면 되는건데.... 라는 생각을 자주합니다 ㅋㅋ 그거랑 별개로 박정빈 교수님이랑 cheak.org에 이런 저런 책을 올리고 있는데요. 바이브 (바이오인포) 코딩 관련 책을 하나 올려놔서.. 혹시나 자료로 쓰실까하여 첨부드립니다~ chaek.org/books/vibe-bio…

그런데 이런 교육을 어떻게 시켜야 하는 걸까... 개념설명 정도는 일단 강의를 몇 개 찍었는데, 예시 데이터셋을 가지고 하는 실습이 필요할 것 같다. 그런데 agentic tool의 유용성을 뽐낼만한 전형적인 사례를 개발하는 게 정말 어렵다. 계속 고민해봐야할 문제

의대에서 agentic ai에 대한 강의를 요청받았는데 서울이라서 거절... 이 주제로 콕 찍어서 요청은 처음 받았다. 이 시기에 꼭 필요한 내용이고 귀찮아서 못 가서 너무 죄송하지만 응원드린다는 진심을 담아 회신을 보냈다.

Why do pathogenic variants in the same gene lead to different neurodevelopmental outcomes? Our Trends in Genetics review discusses how variant effects, genetic background, environment, and developmental noise may all contribute. cell.com/trends/genetic… authors.elsevier.com/a/1mxFv_3rsxXv…

@mahler83 아마 금방 적응하실것 같습니다. 저는 요즘 이것저것에 모두 쓰고 있습니다 ㅎㅎ joonanlab.github.io/notes/llm-wiki… (최근 후기)

@mahler83 됩니다. 한 3-4일 하면 복리처럼 적립이 되는데, 그때부터 진짜 신세계입니다 ㅎㅎ 하실때 제 지스트에도 적어놨지만, 절대로 웹훅으로 외부 소스를 가져오면 안됩니다. 그 규칙을 명시해야해요. 모든 답은 주어진 위키에서만... 만약 못찾겠다 싶으면, 정보가 없다고 하라고 하시는게 좋아요.

트식인께 도움 요청합니다. 내가 가진 자료로 로컬 md파일 지식을 정리하려고 하는데(옵시디언 스타일이 좋아요) 혹시 참고자료 추천해주실 수 있나요? 댓글이나 인용 감사합니다~

@EmilieWigdor @VarunSuresh007 @YUHANHAO2 Well done Emilie. It's really interesting work...!!

📣 Preprint 🧵: we profiled post-mortem human BA22 (speech cortex) in autism across 100 donors using single-nucleus multiomics (~500,000 nuclei), integrating RNA + chromatin accessibility. Shout-out to my co-first authors @VarunSuresh007 and @YUHANHAO2: biorxiv.org/content/10.648…

@V_nDing_machine 히힝(?)님의 글도 기다립니다 ㅎㅎ 재밌을것 같아요. 다 각자 재밌는거 하는거죠... 그게 제가 느낀점.. (어차피 제가 하는것도 저만 재밌습니다)

안교수님같은 분들도 잘 쓰신다... 저런 분들이 본업도 잘 하시면서 ai도 잘 쓰시면 참 쉽지않음... 모래성이라도 크게 쌓기엔 그리 잘 다루지 못하고 그렇다고 뼈대가 튼튼하지도 않은 그런 삶이다

Just pure joy of using Kaparthy llm-wiki. Here I share what I've got so far.. joonanlab.github.io/notes/llm-wiki… Also, Korean version: joonanlab.github.io/notes/llm-wiki…

Just completed the textbook. AI for genomic science chaek.org/books/ai-for-g…

최근 10년동안 자폐 연구는 무엇을 알게 되었을까? 주요 논문들을 바탕으로 책을 작성해보았습니다 자폐 연구의 역사: 빅데이터와 바이오뱅크의 시대 chaek.org/books/autism

인간의 뇌에 대한 신경유전체 교과서를 올립니다 chaek.org/books/humanbra…

“Monogenic” disorders are not so monogenic after all. In Mowat Wilson Syndrome, we show common enhancer variants at RET can modify Hirschsprung disease risk, offering a genetic explanation for phenotypic variability. medrxiv.org/content/10.648… Great collaboration with @tycheleturner

@xinjin @NVIDIAHealth Xin, this is great work! Amazing. Also happy to see Seoyeon on here !

📢 Preprint: we present a whole-mouse-brain in vivo Perturb-seq atlas, 7.7 million cells, 1947 disease-associated perturbations, moving toward direct readout of how human genetics rewires cell states & circuits in vivo. Grateful for the Team! @NVIDIAHealth biorxiv.org/content/10.648…

Excited to share: enhanced capture in vivo multiome Perturb-seq! Worried about low gRNA recovery and waste reads on cells that can’t assign a perturbation? We engineered gRNA transcripts to stay in the nucleus, enabling efficient multiomic Perturb-seq! biorxiv.org/content/10.648…