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"Sex differential effects of developmental heat stress on life-history and reproductive traits" doi.org/10.32942/X2CH4Q
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Keiichi Morita
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Keiichi Morita
@keyM_ecoevo
Posdoc, Hokkaido Univ. - Posdoc, RIKEN - Ph.D student, SOKENDAI - Master student, Univ. Tokyo/ mathematical modelling in ecology and evolution/ Bassoon
北海道大学 Katılım Ağustos 2020
636 Takip Edilen239 Takipçiler
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MIG seqなどのデータから系統樹を作る時、何気に不変サイトの除去が面倒だったのでとてもありがたいです！
はじめての環境DNA@eDNA_startup
大したことはないのですが、iqtreeでML系統樹作成時に不変サイトの除去を行うスクリプトを作成しました。 github.com/NaokiShibata/i… raxml_ascbias.py だとstacksのpopulations.snps.vcfを vcf2phylip.py でPHYLIP形式に変換したファイルで、不変サイトが残る状況が発生してました。 一応、raxml_ascbiasのリポジトリのデモデータで同じ結果が得られることは確認しました。
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📖 Published📖
Trait coevolution and causal inference using generalized dynamic phylogenetic models🧪 🌍
🔎 Find out more: buff.ly/FMcS5ut
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若手研究者向け研究費申請支援GPT (G-DPA) を一般公開しました🎉
2か月前に春の自由研究として開発を始め、ようやく皆様にお届けできるようになりました。Note末尾の「注意事項」「お願い」をご確認・同意の上、ぜひご活用ください！
少しでもお役に立てれば幸いです。
note.com/mishizaka/n/nd…
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元審査員が見た科研申請書
１．なぜ基盤Cで個人でなく複数人申請か
２．業績は多量に羅列しなくて大丈夫(researchmapで確認)
３．申請課題は何をするか明瞭に(△：~の検討,~の総合的研究)
４．美しい申請書は良くも悪くも目に留まりやすい
５．既に実施中の研究進展より新規課題への発展意欲を示す
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How much monitoring is needed to reliably track progress towards genetic diversity targets?
sciencedirect.com/science/articl…
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イネは塩分ストレスで成長が落ちるが、特定の遺伝子ネットワークが回復を助ける。本研究は、ホルモンと栄養（硝酸）の情報が連携し、根の細胞壁を作り替える仕組みを解明。この仕組みを利用すれば、塩に強い作物の開発につながる可能性がある。Plant Communications cell.com/plant-communic…
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Population dynamics of generalist and specialist strategies under feast-famine cycles | PLOS Computational Biology journals.plos.org/ploscompbiol/a…
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ジャーナル投稿の準備中に、イギリスの大学院で教わったことを思い出した
1. 研究には一定の厳密性が必要。その上で面白い知見であること
2. まずは厳密なゴミ論文 (rigour rubbish) を書けるようになりなさい
3. その後に、厳密で面白い論文 (rigorous and interesting) を意識せよ
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📖 Published📖
Confidence intervals for extinction risk: Validating population viability analysis with limited data🌱 🐮
🔎 Find out more: buff.ly/iPtZn8F
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イモリはダニからテトロドトキシンを取得している．フグ毒として知られるテトロドトキシンは実は多くの生物が保有しています．しかしその真の生産者はいまだに不明．この大きな謎を解明するブレイクスルーになることが期待されます：
pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…
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共著論文がEvolutionary Applicationsより出版されました。人新世における寄生虫の急速な適応進化について、その危険性や対抗策について議論した論文です。
onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ev…
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ヒトがいかに地球を改変し、地球から選択圧を受けながら急速に進化してきたかを書きました。人間と地球のEco-Evoフィードバックです。
もしよければご笑覧ください。
前編：ヒトが地球の改変者になるまで
magazine.msz.co.jp/series/evoluti…
後編：地球環境が人間を改変する
magazine.msz.co.jp/series/evoluti…
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以前に授業で実施して盛り上がったのは、最初に生物多様性保全の考え方や手法を私から概説したあとに、学生さんひとりひとりに「絶滅危惧種を1つ選んできて、保全方法について自由に考えてもらって」プレゼンテーションしてもらい、その後皆でよりよい保全方法について議論するというもの。
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ハワイに移り住んで約１ヶ月が経過。とにかく物価が高すぎる。でもそれを補って余りあるほどの大自然！ひとたびサメ調査に出かければ、クジラやマンタ、アザラシが当然のようにお出迎えしてくれます（そして当然巨大なサメも）。来てよかった！
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#TansleyReview: Recombination suppression in plant adaptation and speciation
Zhang et al.
👇
📖 nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/np…
#LatestIssue
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Distinguishing varying and carrying populations in holobiont breeding dlvr.it/TSD446 #plantscience
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Plant pathogen invasion through extracellular defence evasion dlvr.it/TSCQ9S #MicroSky
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