The Knock-in atlas server is back online now. Thank you for your understanding!
English
Okamura Lab
62 posts
Okamura Lab
@lab_okamura
奈良先端科学技術大学院大学•RNA分子医科学研究室です。RNA Molecular Medicine Laboratory at NAIST, Japan.
Katılım Eylül 2020
36 Takip Edilen40 Takipçiler
The Knock-in Atlas server (rnabio.naist.jp/atlas/) will be down for maintenance:
From: March 24, 5:00 PM (JST)
To: March 26, 12:00 PM (JST)
Sorry for the inconvenience!
English
And, for those of you who are interested in making gRNAs against gene introns for NHEJ-mediated knock-in, we also made lists guidelines and genome-wide lists of gRNAs for human and mouse. For more details, please visit rnabio.naist.jp/atlas/
Okamura Lab@lab_okamura
knock-in atlas: a web resource for targeted protein trap by CRISPR/Cas9 in human and mouse cell lines academic.oup.com/nar/article/53… Our knock-in atlas paper is out! The collection has >600 entries for 350 proteins (239 RNA binding proteins) tagged with the Venus fluorescent protein
English
knock-in atlas: a web resource for targeted protein trap by CRISPR/Cas9 in human and mouse cell lines academic.oup.com/nar/article/53… Our knock-in atlas paper is out! The collection has >600 entries for 350 proteins (239 RNA binding proteins) tagged with the Venus fluorescent protein
English
The knock-in atlas website <rnabio.naist.jp/atlas/> will be down soon until Monday October 20th morning (JST). Sorry for the inconvenience!
English
A new version of knock-in Atlas is available now at bioRxiv! The collection has now grown to 350 proteins biorxiv.org/content/10.110…
Okamura Lab@lab_okamura
Want to tag a protein in cell lines? Check out our new preprint and website <yumahanaiatokamuralab.shinyapps.io/KnockInAtlas/>. We made a catalogue of gRNAs against human/mouse introns for inserting artificial exons for protein tagging at endogenous loci.
English
春のインターンシップ生の中尾さんの最終日が明日となりました。どうもありがとう！下田さんはあと一週間ほど、まだよろしくお願いします！花井さん、ご指導感謝します！
日本語
Alhamdulillah !!
I have been awarded the Sasakawa research grant for 2025 academic year by the Japan Science Society (JSS).
Thank you so much @lab_okamura for encouraging me to apply and especially Yuji-san for guiding me through the application process.
English
第5回関西RNAクラブ、皆様のご参加ありがとうございました。活発な交流の場となりました！奈良先端RNA分子医科学研究室の皆さん、準備や運営ありがとうございました（写真に写っていませんが、特に飯田さん、お疲れ様でした！）。
Okamura Lab@lab_okamura
明日の関西RNAクラブ、皆様のご参加楽しみにしています！奈良先端大キャンパスもちょっとだけ春らしくなってきました。明日も暖かいこと願っています！
日本語
明日の関西RNAクラブ、皆様のご参加楽しみにしています！奈良先端大キャンパスもちょっとだけ春らしくなってきました。明日も暖かいこと願っています！
Okamura Lab@lab_okamura
3月14日奈良先端大で第5回関西RNAクラブ開催です。皆様のご参加お待ちしております！rnaj.org/notice/events/…
日本語
Okamura Lab retweetledi
博士研究員の募集をJREC-INに掲載しました。ゼブラフィッシュをモデルとしたRNA研究に興味がある方、プロジェクトや条件面の詳細を知りたい方は、三嶋まで気軽にお問い合わせください。
jrecin.jst.go.jp/seek/SeekJorDe…
Mishima Lab@MishimaLab
博士研究員を1名募集します！着任は4月以降で応相談、ゼブラフィッシュをモデルとしたRNA・翻訳制御の研究がテーマです。詳細が決まったら公募情報を出しますが、それまでにもし興味があれば、ぜひ三嶋まで気軽にお問い合わせください。
日本語
In the mouse and human gRNA sites, you can search for your genes of interest. The gRNA scores and AlphaFold2 pLDDT scores around the tag-insertion sites are useful for finding good gRNAs (Regions with low pLDDT are preferred as such regions tend not to have tight structures.)
English
You can also find confocal Images, flow-cytometry data, Western blot results of knock-in HEK293T lines for 87 genes by clicking the "Go to Collection page" button.
English
Want to tag a protein in cell lines? Check out our new preprint and website <yumahanaiatokamuralab.shinyapps.io/KnockInAtlas/>. We made a catalogue of gRNAs against human/mouse introns for inserting artificial exons for protein tagging at endogenous loci.
bioRxiv Molecular Biology@biorxiv_molbio
The Knock-In Atlas: A web resource for targeted protein trap by CRISPR/Cas9 in human and mouse cell lines biorxiv.org/content/10.110… #biorxiv_molbio
English
3月14日奈良先端大で第5回関西RNAクラブ開催です。皆様のご参加お待ちしております！rnaj.org/notice/events/…
日本語
Congratulations Li Ze for the publication of her PhD work at NAIST! Her findings explain how flies export tRNAs without the canonical export factor Exportin-t.
Exportin-5 binding precedes 5’- and 3’-end processing of tRNA precurso... sciencedirect.com/science/articl…
English
We have a vacant assistant professor position. Please apply if you are interested in studying RNA biology in an environment where you would have a plenty of opportunities to work with graduate students. naist.jp/en/about_naist…
English
多くの大学院生の指導をしつつRNA生物学研究に没頭したい方、本研究室の助教ポジションにご応募ください！naist.jp/job/20231006_a…
日本語