OKI, Shinya（沖 真弥）

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@oki_shinya

Developing an integrative ChIP-seq database (ChIP-Atlas) and a spatial transcriptome technology with photo-isolation chemistry (PIC) in Kumamoto Univ, Japan.

Kumamoto University, Japan Katılım Haziran 2021
462 Takip Edilen469 Takipçiler
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Yoshihiro Yamanishi
Yoshihiro Yamanishi@YoshihiroYamani·
我々のGWASとTWASの融合による創薬標的予測論文をプレスリリースしました。 「希少疾患の創薬標的分子を予測できるAIを開発 〜ゲノムと遺伝子発現を融合し、難治性疾患の治療法の開拓へ〜」 nagoya-u.ac.jp/researchinfo/r…
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Yasuyuki Ohkawa
Yasuyuki Ohkawa@OhkawaYasuyuki·
🚀 Excited to share our new preprint on bioRxiv! Discover MEGA-FISH: a GPU-accelerated Python framework delivering up to 10x faster processing for massive spatial omics images. Perfect for applications in cancer research, neuroscience, and beyond. 🌟 Empower your research today! Explore the preprint here: biorxiv.org/content/10.110…
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Yoshihiro Yamanishi
Yoshihiro Yamanishi@YoshihiroYamani·
核形態情報から心不全の医療診断や予後診断を行う我々の論文が、Bioinformatics誌に出版されました。Vision Transformer を用いて、心臓組織の細胞核形態画像から心不全の可能性、DNA 損傷マーカーを含む二重染色画像から左室逆リモデリング (LVRR)を予測します。 academic.oup.com/bioinformatics…
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OKI, Shinya（沖 真弥）@oki_shinya·
出張で京都大学の芝蘭会館に宿泊しているのですが、トイレのフタを開けたら、なんとヤモリが！ めっさ可愛いし、ていうか、なんでそこにおったん？？
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Yoshihiro Yamanishi
Yoshihiro Yamanishi@YoshihiroYamani·
漢方薬リポジショニングに関する我々の論文がMolecular Informatics誌に出版されました。漢方薬を構成する生薬の比率を考慮し、生薬成分化合物群が複合的に作用する疾患関連パスウェイの制御の視点から、漢方薬の新規効能や作用機序を探索する情報技術を開発しました。 onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mi…
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Kenji Kamimoto
Kenji Kamimoto@kenjikamimoto68·
I'm happy to announce that I will become a PI and start my lab at Osaka University this October!! I will be joining the Research Institute for Microbial Disease (RIMD) and the Premium Research Institute for Human Metaverse Medicine (PRIMe) at Osaka University.
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OKI, Shinya（沖 真弥）@oki_shinya·
@_JSDB_ お引き立ていただき、ありがとうございます。熊本大学にラボを移転して半年が過ぎましたが、おかげさまで不自由なく研究を進めております。PICやChIP-Atlasを使用した共同研究もバンバンおこなっておりますので、どうぞよろしくお願いいたします！
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JSDB
JSDB@_JSDB_·
本田 直樹 @HondaNaok　名古屋大学 以下のお二人は4月分のリストから漏れていました。お詫び申し上げます。 沖 真弥 @oki_shinya 熊本大学　oki-lab.jp 大森 義裕 広島大学　yoshihiroomori.web.fc2.com 他にご存じでしたら返信でお知らせください
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Kyoko Miura
Kyoko Miura@debadebaba·
ほぼ日刊イトイ新聞にご取材いただき、ハダカデバネズミ連載スタートです！
ほぼ日（ほぼにち）公式@1101complus

新連載はじまりました！ 老化しない。がんにならない。寿命はネズミの10倍以上。謎につつまれたハダカデバネズミから「老いと死」について考えます。日本のハダカデバネズミ研究の第一人者「くまだいデバ研」の三浦恭子さんにお話をうかがいました。 1101.com/n/s/oitoshi_na…

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熊本大学 Kumamoto University
熊本大学 Kumamoto University@kumamotoUniv_PR·
🆕プレスリリース！ 発生医学研究所の衛藤 貫特任助教、中尾光善教授らは、老化細胞による炎症反応を促進する酵素「ACLY」とその阻害効果を初めて発見しました。今後、細胞老化による慢性炎症の制御法の開発に繋がることが期待されます。 ▼詳細はこちら kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seime… #熊本大学
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Yoshihiro Yamanishi
Yoshihiro Yamanishi@YoshihiroYamani·
我々のiScience誌に出版された論文ですが、日本語でプレスリリースしました。AlphaFoldで得られた全タンパク質の立体構造を用いて、約8千種類の既存薬と約2万種類のヒトタンパク質の全対全のドッキングシミュレーションを行い、薬効や毒性・副作用を予測する内容です。 nagoya-u.ac.jp/researchinfo/r…
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Yasuyuki Ohkawa
Yasuyuki Ohkawa@OhkawaYasuyuki·
Thrilled to share our latest ChIL technology is finally out as single cell multiomics. The manuscript titled "Tracking chromatin structure changes by single-cell multi-epigenomics with RNA polymerase II binding profiles" is opened on doi.org/10.21203/rs.3.….
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Yoshihiro Yamanishi
Yoshihiro Yamanishi@YoshihiroYamani·
日経クロステックで、我々のオミクス情報に基づく創薬AIの研究が、「常識を超えた創薬をAIで実現、遺伝子の発現や化合物の合成にも着目」というタイトルで紹介されました。 xtech.nikkei.com/atcl/nxt/colum…
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Yuichi Shichino
Yuichi Shichino@u1_7no·
岩崎研にきてからメインでずっとやってた仕事がついに @NatureSMB から出版されました！翻訳活性化因子eIF4A1が飢餓時の翻訳抑制においてはむしろ抑制を強めるように働く、という内容です。共同研究者の皆様、この仕事をサポートして頂いた皆様に感謝します！nature.com/articles/s4159…
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熊本大学 Kumamoto University
熊本大学 Kumamoto University@kumamotoUniv_PR·
🆕プレスリリース 生命資源研究・支援センターの鄒 兆南助教ら研究グループは共同研究により、世界最大規模のエピゲノム統合データベースChIP-Atlasのメジャーアップデートを実施しました。遺伝性疾患の解明、新規創薬標的の探索、再生医療などの分野への応用が期待されます。 kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seime…
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