Pablo Carbonell-Bejerano

619 posts

Pablo Carbonell-Bejerano banner
Pablo Carbonell-Bejerano

Pablo Carbonell-Bejerano

@pcarbonellb

Plant genomics and #grapevine improvement at @icvv_rioja

Logroño Katılım Haziran 2018
441 Takip Edilen420 Takipçiler
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Yongjian Wang
Yongjian Wang@wangyongjian7·
🍇🍇🍇We develop advanced tools to study grapevine traits like berry quality and stress resilience. A 200K SNP array and high-throughput phenotyping enable identification of loci linked to important traits.🍇🍇🍇 advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ad…
English
1
1
2
148
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Steven Salzberg 💙💛
Steven Salzberg 💙💛@StevenSalzberg1·
Check out our just-published AI-based (temporal convolutional network) system, PSAURON, for predicting eukaryotic proteins, from @markusjsommer. We used a similar method in BALROG, our bacterial gene finder. Note: the "P" is silent in PSAURON 🤣 academic.oup.com/nargab/article…
English
1
25
80
10.1K
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Dario Cantù
Dario Cantù@CantuLab·
New preprint from the lab biorxiv.org/content/10.110… describing the conservation of the grape sex determining region (SDR) across angiosperm genomes and detailed history within Vitaceae leading to dioecy in Vitis and Muscadinia. Collaboration with @shiversherlock
English
1
4
7
1.2K
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
brent pedersen
brent pedersen@brent_p·
new tool: vcfexpress let's user apply lua expressions to filter/modify a VCF and optionally to write templated output: github.com/brentp/vcfexpr… it's fast. feedback appreciated. Work with @aaronquinlan
English
2
28
106
10.2K
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Hajk-Georg Drost
Hajk-Georg Drost@HajkDrost·
How do you quantify the natural variation of plant immunity? Thrilled to announce the preprint publication of our superb collaboration effort led by @gaushi, @PlantEvolution, Luisa Teasdale, and Kevin Murray on inferring NLR biodiversity across natural Arabidopsis accessions. 🌱
Gautam Shirsekar@gaushi

We constructed a pangenome graph with #pggb @erikgarrison to crawl along the regions of the genomes where NLRs or pieces of NLRs are found at least in 1 accession UNTIL we found common (syntenic) anchors bordering those regions in all the accessions --> "NLR neighborhood"

English
0
6
18
1.8K
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Damian Cambiagno
Damian Cambiagno@DamianCambiagno·
Hemos encontrado que hay unas moléculas de ARN pequeños (microARN), que pueden tener que ver con esta memoria inmunitaria . En la planta hay muchos microARNs, y ¡estamos detectando que algunos de ellos la regulan! #HilandoCiencia2024
GIF
Español
1
3
22
703
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Damian Cambiagno
Damian Cambiagno@DamianCambiagno·
¿Y por qué puede fallar?, bueno, estem… no lo sabemos bien. ¿Y si pudiéramos saber más sobre cómo las plantas adquieren memoria inmunitaria, y aprovecharlo biotecnológicamente? No se diga más ¡Vamos a estudiarlo! #HilandoCiencia2024
GIF
Español
1
4
26
933
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
Damian Cambiagno
Damian Cambiagno@DamianCambiagno·
🧵¿Sabías que las plantas se defienden de patógenos y tienen memoria inmunitaria, igual que los animales? ¡Si lo hacen, y muy bien! Podemos aprovechar esto para que nuestros cultivos sean más resistentes. Pero, puede fallar… #HilandoCiencia2024
GIF
Español
1
70
166
7.4K
Pablo Carbonell-Bejerano retweetledi
𝘔𝘪𝘴𝘴 𝘚𝘢𝘭𝘮𝘰𝘯𝘦𝘭𝘭𝘢
‼️Ofertamos contrato de 4 años para biólogos, bioquímicos, biotecnólogos y bioinformáticos para la realización de la tesis en el ámbito de la Bioinformática💻, análisis de datos 📈📊y modelización para el avance de la vitivinicultura 🍇 a través del programa @Momentum_CSIC
𝘔𝘪𝘴𝘴 𝘚𝘢𝘭𝘮𝘰𝘯𝘦𝘭𝘭𝘢 tweet media
Español
4
175
151
32.4K