八九 安高

睡眠脳波解析のコードを汎用化しました。データ・フィルタリング・アーティファクト除去・PSD比較を関数化し、別データにも対応できる形に。加えてPhysioNetのSleep-EDF Databaseも精査しデータ形態について学びました。 #Python #神経科学 #計算神経科学 #睡眠科学 github.com/yasu-hack89/pr…

睡眠脳波データの前処理パイプラインを構築する手法を学びました。 0.5〜30Hzでノイズ除去→30秒エポックに分割→200μV超の異常エポック等の排除。2649個中2022個のクリーンなデータが得られました。 解析の土台を知った気分です。 #Python #神経科学 #計算神経科学 #睡眠科学 github.com/yasu-hack89/pr…

REM睡眠とノンレム睡眠の脳波をパワースペクトル密度で比較しました。 低周波域ではNREMが優位、シータ波域ではREMが優位であることに疑問を抱き調べたところ、これが標準であることを初めて知りました。 #Python #神経科学 #計算神経科学 #睡眠科学 github.com/yasu-hack89/pr…

MNE-Pythonで睡眠脳波データからREM睡眠を切り出しました。ピンクの部分がREM睡眠中です。これからさらに学んでいきます。 #Python #神経科学 #計算神経科学 github.com/yasu-hack89/pr…

MNE-Pythonで本物の睡眠脳波データを可視化しました。1989年に計測された33歳女性の22時間分の睡眠ポリグラフデータです。EEG・EOG・EMGが全部入っていました。次はさらに抽出する方法を学びます。 #Python #神経科学 #計算神経科学 github.com/yasu-hack89/pr…

Numpyも学びました。Claudeに教わりながらなんとか概念を入れていってます。これから練習して慣れていきます。 #計算神経科学 #Python #神経科学 github.com/yasu-hack89/pr…

初めてmatplotlibに触れました。これから練習して慣れていきます。 #計算神経科学 #Python #神経科学 github.com/yasu-hack89/pr…

フェンタニル（fentanyl）がオピオイド受容体（opioid recepter）に結合するような映像を作成しました。 分子のブレの再現が非常にシビアで、少しパラメータをいじるだけで分子が飛散してしまうため、挙動の制御にかなり手こずりました。 #blender #molecularnodes #opioid #Fentanyl