YUGI, Katsuyuki

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Genome-scale system identification

Yokohama, Japan Katılım Haziran 2010
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YUGI, Katsuyuki@yugism·
これは前ボスと話していて一致したことなんだが、異分野融合は1人の人間の脳内でしか起きない。異分野の人間を1カ所に集めて「さあ融合しろ」と言っても何も起きない。今まで見てきた中で、分野融合で新しいことを生み出す人は例外なく自分で手を動かして異分野のことを学んでいた。
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東北ろっけん雑学メディア:NEFT(ネフト)編集部
中国大陸にかつてあったとされる国・渤海(ぼっかい) この国には「34回、使節団を日本に派遣した」という記録が残っていましたが、どこに派遣されたのか長らく判明していませんでした。 しかし秋田城跡(高清水公園)から発見された遺構からその場所が秋田であることが判明。その遺構とは… 古代の水洗トイレの遺構🚽 この遺跡から見つかった排泄物から、当時日本では食べられていなかった豚につく寄生虫の卵が見つかり、豚を食していた渤海からの使者が来訪していたと考えられるようになったそうです…。 何が世紀の発見に繋がるかわかりませんね…。
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Atsushi SHIMIZU
Atsushi SHIMIZU@atsushi_ngs·
東北大学でも医学系研究科の兼務をいただきました。 27才の研究者の卵の時から医学部で研究・教育に関わらせていただいている事の期待と義務とチャンスをしっかり受け止めて再度研究室を立ち上げていきます!! med.tohoku.ac.jp/laboratory/vie…
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我々の分野との関係で言うと、数値積分のアダムズ=バッシュフォース法にその名が残っています。 "The Adams–Bashforth methods were designed by John Couch Adams to solve a differential equation ..." en.wikipedia.org/wiki/Linear_mu…
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海王星の発見は私が特に好きな科学史エピソードの1つです。 データと数理モデル(ニュートン力学)が予言した通りの位置に惑星が見つかるなんて、実にエレガントだと思いませんか。
よーん|理学博士のゆるふわ科学解説@usephys

これ、熱い話なので聞いてほしい!  海王星の発見で先を越された、静かな天才の物語。 19世紀、人々は世紀の難問に頭を悩ませていた。 観測される天王星の位置が、どうしても計算と合わなかった。 「観測ミスでは?」 「計算がまだ不完全なのでは?」 「ニュートン力学が間違っているのでは?」 しかし、大学を卒業したてのイギリスの数学者、ジョン・クーチ・アダムズは、考えた。 「そうじゃない。もっと外側に、まだ見ぬ惑星がいる。」 彼がやったのは、とんでもない計算。 未知の惑星の質量、軌道、位置を、天王星のズレだけから逆算しようとしたのだ。 当時、それが可能であると考えた者は少なかった。 まさに数式で暗闇の向こうを透視するような仕事。 何年も、来る日も来る日も計算に明け暮れた。 結果、アダムズは誰よりも先にそこへ到達した。 未知の惑星の尻尾を、ついに掴んだのだ。 なのに。 導き出した惑星の研究結果を伝えても、イギリス天文学界は本気で動かなかった。 信じ切らなかった。すぐに探さなかった。 そうこうしているうちに、その翌年フランスのルヴェリエが、アダムズとは独立に同じ結論に達した。 彼はベルリン天文台に探索願いを出す。 「夜空のこの範囲を探してほしい。そこに未知の惑星が見えるはずだ」と。 手紙を受け取ったその夜、天文台が望遠鏡を向けた先に、それはいた。 太陽系で最も遠い惑星、海王星の発見だった。 発見の栄誉はルヴァリエに与えられた。 あまりに切ない。 先に「見抜いて」いたのに、先に「見つけた」のはアダムズではなかった。 アダムズの成果を知っていたイギリスは、すぐさま海王星発見の先取権を主張し、国の威信を賭けた先取権争いへと発展する。 でもアダムズは、自分の手柄を叫ばなかった。 論争に加わらず、静かに学問を続けた。 名誉より真理を選んだ。 彼はその後、しし座流星群の軌道計算や、月の運動の研究などで次々と重要な成果を打ち立て、やがてイギリス天文学を背負う存在になっていく。 海王星発見の物語は、 よく「数式が惑星を見つけた奇跡」として語られる。 もちろんそれはその通りだ。 でもその裏には、 計算そのもののすごさだけじゃなくて、 認められなくても腐らず、争いに乗らず、最後まで学問への情熱を失わなかった、 ジョン・クーチ・アダムズという人物の美しさがある。 #海王星 #栄誉より真理の探求

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@usephys アダムズは数値積分のアルゴリズムにもその名を残しています!(アダムズ=バッシュフォース法) "The Adams–Bashforth methods were designed by John Couch Adams to solve a differential equation ..." en.wikipedia.org/wiki/Linear_mu…
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よーん|理学博士のゆるふわ科学解説
これ、熱い話なので聞いてほしい!  海王星の発見で先を越された、静かな天才の物語。 19世紀、人々は世紀の難問に頭を悩ませていた。 観測される天王星の位置が、どうしても計算と合わなかった。 「観測ミスでは?」 「計算がまだ不完全なのでは?」 「ニュートン力学が間違っているのでは?」 しかし、大学を卒業したてのイギリスの数学者、ジョン・クーチ・アダムズは、考えた。 「そうじゃない。もっと外側に、まだ見ぬ惑星がいる。」 彼がやったのは、とんでもない計算。 未知の惑星の質量、軌道、位置を、天王星のズレだけから逆算しようとしたのだ。 当時、それが可能であると考えた者は少なかった。 まさに数式で暗闇の向こうを透視するような仕事。 何年も、来る日も来る日も計算に明け暮れた。 結果、アダムズは誰よりも先にそこへ到達した。 未知の惑星の尻尾を、ついに掴んだのだ。 なのに。 導き出した惑星の研究結果を伝えても、イギリス天文学界は本気で動かなかった。 信じ切らなかった。すぐに探さなかった。 そうこうしているうちに、その翌年フランスのルヴェリエが、アダムズとは独立に同じ結論に達した。 彼はベルリン天文台に探索願いを出す。 「夜空のこの範囲を探してほしい。そこに未知の惑星が見えるはずだ」と。 手紙を受け取ったその夜、天文台が望遠鏡を向けた先に、それはいた。 太陽系で最も遠い惑星、海王星の発見だった。 発見の栄誉はルヴァリエに与えられた。 あまりに切ない。 先に「見抜いて」いたのに、先に「見つけた」のはアダムズではなかった。 アダムズの成果を知っていたイギリスは、すぐさま海王星発見の先取権を主張し、国の威信を賭けた先取権争いへと発展する。 でもアダムズは、自分の手柄を叫ばなかった。 論争に加わらず、静かに学問を続けた。 名誉より真理を選んだ。 彼はその後、しし座流星群の軌道計算や、月の運動の研究などで次々と重要な成果を打ち立て、やがてイギリス天文学を背負う存在になっていく。 海王星発見の物語は、 よく「数式が惑星を見つけた奇跡」として語られる。 もちろんそれはその通りだ。 でもその裏には、 計算そのもののすごさだけじゃなくて、 認められなくても腐らず、争いに乗らず、最後まで学問への情熱を失わなかった、 ジョン・クーチ・アダムズという人物の美しさがある。 #海王星 #栄誉より真理の探求
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「反照的」の reflective というのは自分に向けた鏡の反射 (reflection) のことなのでしょう。内省という意味もあるようですし。
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YUGI, Katsuyuki@yugism·
反照的均衡(reflective equilibrium)は、自分の言動の一貫性を高めて自分なりのルールを見つけるのに役立つ考え方です。 実践するには「過去の自分の主張と、今から言うことは矛盾していないか?」と自分に問うて、より一貫性のある方向に進めばいい。到達した状態を「反照的均衡」と呼びます。
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はじめまして 平岡です
はじめまして 平岡です@HiraokaYasushi·
学会でのレセプションを科研費で支出できるか、よく話題になるが、日本学術振興会のFAQで2025年に更新された項目に以下のものがあったので、共有します。「学会参加費に組み込まれ不可分のレセプションは学会活動の一環、、、支出可能と考えます」 (科研費FAQ R7.11版) jsps.go.jp/file/storage/k…
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Taku Tsuzuki
Taku Tsuzuki@kuroyamant·
「認知の律速を突破するAI駆動知識掘削 ―個別分子解析における次の一手の自律的探索」と題して私も寄稿させていただきました! 個別分子解析問題を科学コミュニティの挙動を模した群探索で解決する手法を紹介しています。ぜひ手に取っていただけると嬉しいです!
YUGI, Katsuyuki@yugism

山西先生(名大)と柚木が編集した実験医学増刊がこのほど刊行されました。 創薬や薬理をテーマとしたオミクス、ケモインフォマティクス研究の動向を俯瞰するための1冊としてぜひご検討ください。 お忙しい中ご寄稿いただいた先生方に深く御礼申し上げます。 yodosha.co.jp/jikkenigaku/bo…

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山西先生(名大)と柚木が編集した実験医学増刊がこのほど刊行されました。 創薬や薬理をテーマとしたオミクス、ケモインフォマティクス研究の動向を俯瞰するための1冊としてぜひご検討ください。 お忙しい中ご寄稿いただいた先生方に深く御礼申し上げます。 yodosha.co.jp/jikkenigaku/bo…
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羊土社 実験医学
羊土社 実験医学@Yodosha_EM·
📢新刊・本日発行 実験医学増刊号『AI・データ駆動型創薬研究』 AI×大規模データの融合で,創薬研究は新たなステージへ💊 ✅️「マルチオミクス」「ケモインフォマティクス」という2つの切り口から捉えた,創薬・薬理研究の最先端研究を網羅 ✅️製薬企業や国内のAI創薬関連プロジェクトの最新動向も❗️ 目次詳細,ウェブ立ち読みはこちらから📖 yodosha.co.jp/jikkenigaku/bo…
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Atsushi SHIMIZU
Atsushi SHIMIZU@atsushi_ngs·
にゃんこのマルチオミックスとAIで個別化予防基盤整備して、ヒトの疾患発症と、にゃんこの疾患発症の頻度の違いをゲノムから明らかにする、とかの妄想科研費計画書でも書くかな。
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YUGI, Katsuyuki
YUGI, Katsuyuki@yugism·
人生の苦難に対してどんな態度を取るか。 その態度によって、人は価値を生み出すことができる。 精神科医V・フランクルが唱えた「態度価値」という考え方です。 選挙に敗れた政治家が公の場に出てくるかどうかを見れば、その人の器がわかるという意味のポストを複数見て、これを思い出しました。
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@piyota0 「dryからwetへ」を体験した側です。 シグナル分子の生化学実験を経験して、 「『1分間隔の時系列って取れないんですか?』とか言って申し訳ありませんでしたぁぁぁ!!」 と得心し、以後は現実的なデータ量を意識してパイプラインを設計するようになりました。 脳内分野融合には決定的な体験です。
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