Georgios (Yiorgos) Kalantzis

@doctorveera Very exciting and inspiring move, Veera! Good luck, and keep us posted!

After a decade abroad in research, I am happy to be home 🇮🇳. I am excited to share that I am joining the AI healthcare startup Wellytics as Chief Scientific Officer. I trained as a physician in India. I moved abroad to pursue human genetics and later focused on genetics-driven target discovery and drug development at Regeneron. Returning now to build in India feels deeply meaningful. At Wellytics, I will lead R&D and build our genomics division. - We will establish large-scale Indian genomic datasets to power drug discovery. - We will build a world-class human genetics and target discovery team. - We will collaborate closely with academic geneticists across India. - We will provide tools, training, and support to strengthen human genomics research in India. Wellytics is digitizing Indian healthcare and making it AI ready. We will combine AI, clinical data, and genomics to generate real-world evidence and build international-grade genetic association resources for India. Excited to help build a genetics-driven drug discovery engine in India!

Our package can be pip-installed so please check out our manual for the details palamaralab.github.io/software/arglm…

Very proud that our paper, introducing ARG-RHE and other methods for scalable complex-trait analyses inside an #ARG, is now published at @CellGenomics. It includes some work from my thesis, but most of it was pushed by my co-first author Jiazheng. Congrats!

Our latest work is out in Nature today. In this paper, we introduce an improved version of NanoSeq, a duplex sequencing protocol with <5 errors per billion bp in single DNA molecules, and use it to study the oral somatic mutation landscape in >1000 people. nature.com/articles/s4158…

@StefanosTyros Το να κάνεις 2-3 μήνες εκπαίδευση, και να φεύγεις, το καταλαβαίνω. Το να κάνεις όμως 9-12 κλπ μήνες θητεία κυρίως για να κάνεις σκοπιά, σε μια εποχη που υπαρχουν drones και όλων των ειδων η τεχνολογία, είναι απλά χαζό. Κατά τη γνώμη μου... μακριά από αυτού του είδους τη θητεία!

@StefanosTyros Ποιο είναι το χρέος μας ακριβώς? Να φυλάμε αποθήκες με πυρομαχικά από το '80 και κρατώντας εξοπλισμό που μαλλον δεν λειτουργεί? Για μένα αυτό είναι μια γελοιότητα και χάσιμο χρόνου. Επίσης το άλλο, μας έδιναν "αμοιβη" 9.5€ το μήνα.

Ο Στρατός και Εγώ Πρόσφατα ανακοινώθηκαν αλλαγές στη στρατιωτική θητεία. Οι τρεις βασικότερες είναι: 1. Η θέσπιση κινήτρων για να υπηρετεί κανείς στα 18. 2. Αλλαγές στη δομή των Ενόπλων Δυνάμεων. 3. Μέτρα για να μειωθεί ο αριθμός όσων αποφεύγουν τη στράτευση. Στο πλαίσιο της τρίτης αλλαγής περιλαμβάνεται και η τροποποίηση του καθεστώτος εξαγοράς της θητείας. Σήμερα η εξαγορά είναι δυνατή στο 33ο έτος της ηλικίας, ενώ με την προτεινόμενη ρύθμιση η δυνατότητα αυτή θα μεταφέρεται στο 40ό έτος. Θα ξεκινήσω με ένα μικρό προσωπικό ιστορικό της σχέσης μου με τη στρατιωτική θητεία. Μετά από κάποιες επιτυχίες μου στις μαθητικές Ολυμπιάδες επιστημών ως μαθητής Λυκείου, έφυγα κατευθείαν από την Ελλάδα για να σπουδάσω στην Αγγλία. Αρχικά ασχολήθηκα με τη Θεωρητική Φυσική, όμως στη συνέχεια στράφηκα στα Οικονομικά και συνέχισα εκεί την έρευνά μου. Έπειτα ξεκίνησα το διδακτορικό μου. Ο τρόπος που λειτουργεί η Διεθνής Αγορά Εργασίας για τους οικονομολόγους ουσιαστικά υπαγορεύει να κάνεις απευθείας αιτήσεις για την επόμενη ερευνητική σου θέση μόλις ολοκληρώσεις το διδακτορικό. Έτσι, λίγο αργότερα, βρέθηκα στο Χάρβαρντ και στη Μασαχουσέτη. Στο μεταξύ, απέκτησα και δύο παιδιά. Αυτή τη στιγμή, για πρώτη φορά μετά από αρκετά χρόνια, συζητάμε σοβαρά στην οικογένειά μας το ενδεχόμενο επιστροφής στην Ελλάδα, είτε για ερευνητικές θέσεις είτε για άλλες ευκαιρίες. Ένας από τους σημαντικότερους λόγους αυτής της σκέψης είναι και το ζήτημα της γλώσσας, που αφορά την ανατροφή των παιδιών. Είμαι επίσημα αναγνωρισμένος και μόνιμος κάτοικος εξωτερικού, καθώς ζω τα τελευταία 13-14 χρόνια εκτός Ελλάδας, με μόνο μικρές περιόδους εντός Ελλάδας. Σύμφωνα με το ισχύον καθεστώς, σε περίπτωση επιστροφής μπορούσα να κάνω χρήση του κανονισμού που προέβλεπε την εξαγορά της θητείας στο 33ο έτος της ηλικίας. Αυτό το όριο το πλησιάζω σε λίγους μήνες. Η διαδικασία, όπως τη γνώριζα, ήταν να ολοκληρώσω τη βασική εκπαίδευση στον στρατό και στη συνέχεια να εξαγοράσω τους υπόλοιπους μήνες που θα απέμεναν στη θητεία μου. Με αυτόν τον τρόπο θα συνέβαλλα με τον χρόνο μου στη βασική εκπαίδευση, ενώ για το υπόλοιπο διάστημα θα κατέβαλλα ένα χρηματικό ποσό, το οποίο θα μπορούσε να στηρίξει τον ελληνικό στρατό. Ο στρατός, άλλωστε, είναι για μένα σημαντικό να συνεχίσει να υπάρχει και να διατηρεί αξιόμαχες δυνάμεις – αν και η προσωπική μου φιλοσοφία μακροπρόθεσμα τείνει περισσότερο σε έναν κοινό επαγγελματικό ευρωπαϊκό στρατό. Το ποσό που προβλέπεται κυμαίνεται γύρω στις 5.000–7.000 ευρώ, ανάλογα με τους μήνες που πρέπει να εξαγοράσει κανείς. Πρόκειται για ένα σημαντικό ποσό, ιδιαίτερα για κάποιον που βρίσκεται ακόμη στην αρχή της σταθερής του εργασιακής πορείας. Αν όμως αλλάξει το πλαίσιο και πάψει να δίνεται αυτή η δυνατότητα στην ηλικία των 33–40 ετών, τότε πρακτικά η επιστροφή μας στην Ελλάδα θα καταστεί απαγορευτική. Και αυτό όχι επειδή θεωρώ τον στρατό κάτι που πρέπει κανείς να αποφύγει πάση θυσία. Αν οι συνθήκες το επέτρεπαν, θα ήμουν χαρούμενος να κάνω ένα εννιάμηνο. Μάλιστα, σε σχέση με το απαιτητικό πρόγραμμα ενός πλήρους ερευνητικού έργου μαζί με δύο παιδιά, η στρατιωτική καθημερινότητα θα μπορούσε να θεωρηθεί πιο ήπια, λίγο σαν διακοπές στην παραμεθόριο. Ωστόσο, το ζήτημα για μένα είναι άλλο: δεν είμαι διατεθειμένος να αφήσω τα παιδιά μου για τόσους μήνες, και ιδιαίτερα το μικρό που είναι μόλις λίγων μηνών. Ταυτόχρονα, παρόλο το σημαντικό κόστος της εξαγοράς, η έλλειψη από την αγορά εργασίας για τόσους μήνες θα ήταν πολύ πιο επίπονη για μια οικογένεια. Ουσιαστικά θεωρώ το χρέος μου απέναντι στα παιδιά μου πιο σημαντικό από το χρέος μου απέναντι στις στρατιωτικές μου υποχρεώσεις. Γιατί αυτό έχει σημασία; Επειδή η χώρα τα τελευταία χρόνια κάνει μια οργανωμένη προσπάθεια επαναπατρισμού επιστημόνων και εργαζομένων, το γνωστό brain regain. Έχουν θεσπιστεί συγκεκριμένες πολιτικές, όπως η μείωση του φόρου για όσους επιστρέφουν, καθώς και μια σειρά από εκδηλώσεις ανά τον κόσμο με στόχο τη δικτύωση και την ενίσχυση της επιστροφής. Σημαίνει αυτό ότι δεν πρέπει να γίνει η αλλαγή της θητείας; Όχι αναγκαστικά. Σημαίνει όμως ότι το κράτος πρέπει να λάβει υπόψη του τις πιθανές αρνητικές επιπτώσεις μιας τέτοιας αλλαγής στον επαναπατρισμό επιστημόνων, πολλοί από τους οποίους έχουν ήδη οικογένεια και παιδιά – κάτι που σχετίζεται άμεσα και με τη γενικότερη συζήτηση γύρω από το δημογραφικό πρόβλημα. Εξαιρετικά ενδιαφέρουσα είναι επίσης η πρόταση για στράτευση στα 18. Από νωρίς, ήδη όταν έκανα το μεταπτυχιακό μου, σκεφτόμουν ότι θα ήταν καλό να είχα κάνει τη θητεία μου στα 18. Τότε βέβαια ήμουν αποφασισμένος να φύγω για το εξωτερικό και κανένας γύρω μου δεν το έκανε. Είχα όμως γνωστούς Κύπριους από τις Ολυμπιάδες, οι οποίοι όλοι υπηρέτησαν κατευθείαν. Αν αυτό ήταν πιο συνηθισμένο στην Ελλάδα, πιθανότατα θα το είχα κάνει και εγώ, κάτι που θα είχε απλοποιήσει πολύ τα πράγματα στη συνέχεια. Το ερώτημα όμως είναι πώς πρέπει να γίνει η αλλαγή σήμερα. Ο @GreekAnalyst έγραψε ότι η αλλαγή για την εξαγορά της θητείας θα πρέπει να ισχύσει για τους σημερινούς 18χρονους και όχι για όσους βρίσκονται τώρα στην ηλικία των 33. Προφανώς συμφωνώ, αλλά έχω και προσωπικό συμφέρον.

@sharmavarun840 Hi Varun, thanks for reaching out! Certainly! Would you like to send me an email with more details and discuss options?

@YiorKalantz Great and its a great work and We have also sequences almost 150 wes of established cardiomyopathy individuals of North and west India. Would like to collaborate, if possible.

Preprint alert! 🚨 Our manuscript on Exome sequencing and analysis of 44,028 British South Asians (Genes & Health) is now live @medrxivpreprint! Among great findings, and I’m thrilled to highlight the pieces I worked on 🧵 doi.org/10.1101/2025.0…

The Greek government’s decision to delegate newborn screening to private organisations without prior public consultation raises concerns about transparency and ethical oversight. Read the full ESHG statement for details: eshg.org/news-home/for-… #NewbornScreening #eshg

Grateful to all collaborators—especially @hilsomartin —and to the Genes & Health participants who made this study possible. Dive into our full manuscript here: doi.org/10.1101/2025.0…

Follow-up with a joint additive/dominant model, for each of those 13, we assessed a 2-df model which revealed three associations - all novel - with strong recessive patterns  – NLRP10 → Viral pneumonia risk  – HSD17B14 → Bone density disorders  – NCAPD2 → Vitamin B₁₂ levels

@TheodoreLytras Έχει ανακοινωθεί πουθενά ποιοι επιστήμονες θα τρέξουν αυτό το πρόγραμμα? Το μόνο που βρήκα ήταν η παρακάτω σελίδα που τη λες και ψιλο-αδεια...

Ανοιχτή επιστολή απο 195 επιστήμονες (εις εξ'αυτών κι εγώ) προς τις ελληνικές αρχές εναντίον της σύμβασης γονιδιωματικού ελέγχου 100.000 νεογνών του Υπ.Υγείας με ιδιωτική εταιρεία, η οποία δεν πληρεί βασικές επιστημονικές και ηθικές προϋποθέσεις. drive.google.com/file/d/192GNC1…

Hi #ESHG2025 it's great to be part of the conference and hear about exciting science! I'm giving a talk myself on a recessive meta-analysis from BRaVa, 11:45 on Tuesday at C32. Hope to meet many if you!

Our work on widespread recessive effects on common diseases in a British South Asian cohort is now published in AJHG! Check out our summary thread here cell.com/ajhg/fulltext/…

@dr_appie Hi, I'd love to have one too! If you're keen on exporting to the UK 😆

I'm developing a strategic 1-on-1 game called Base Pair™ – based on biologically accurate rules 🧬🎲 Want to play and give feedback? Reply to this tweet (or RT), and I might send you a free handmade beta copy! (I have a limited nr right now, but more are on the way)

Glad to be part of this project, introducing a new method to perform powerful and scalable GWAS 👇

@thaoshibe Good point but, $199 for a poster?! Maybe that's the problem one needs to solve! It's about £40-60 in the UK

It costs $89-$199 for a poster printing Estimated $260.000-$597.000 for ~3k posters (main conference) $0.5M dollars go to the trash bin right after 3 hours 😭 I feel sad, is there any more sustainable way to reduce this waste?? 🥹 #NeurIPS2024 #NeurIPS