Julien A. Nguinkal, PhD

1000 Powerful Claude Prompts🤯 For builders, developers & creators. I spent weeks compiling the most practical prompts for: • Coding & debugging • AI workflows • Research & analysis • Automation • Content creation • Productivity systems These prompts can replace hours of manual work. To celebrate finishing this prompt book, I’m giving it away to a few people here. How to get access: Follow MUST (so I can dm) Repost + Like Comment 'Prompt'

BioPipelines: Accessible Computational Protein and Ligand Design for Chemical Biologists biorxiv.org/content/10.648…

After two years of work, we’ve made an AI Scientist that runs for days and makes genuine discoveries. Working with external collaborators, we report seven externally validated discoveries across multiple fields. It is available right now for anyone to use. 1/5

#Ethiopia has confirmed the outbreak that has infected at least 9 people in the south of the country is of #Marburg virus disease. I commend Ethiopia’s @FMoHealth for its rapid and transparent response to the outbreak, and the work of the Ethiopia Public Health Institute and regional health authorities. This fast action demonstrates the seriousness of the country’s commitment to bringing the outbreak under control quickly. @WHO, at country, regional and headquarters levels, is actively supporting Ethiopia to contain the outbreak and treat infected people, and supporting all efforts to address the potential of cross-border spread.

[Review] The applications and advantages of nanopore sequencing in bacterial antimicrobial resistance surveillance and research. #nanopore #ARG doi.org/10.1038/s44259…

@Nouchka__9 Ils veulent la légitimation de leur manœuvres obscures.

Depuis hier, les partisans de Kamto s’offusquent du fait que Cabral n’ait pas pris la parole sur les personnes qui meurent. Mais pourquoi vous semblez plus préoccupés par ce que Cabral dit ou ne dit pas que par ce que Kamto lui-même déclare ? S’il vous plaît, montrez-moi le communiqué officiel de Kamto à ce sujet, ou alors j’ai dû le rater ? Ou bien, on parle de Cabral exprès pour détourner l’attention du silence de Kamto, histoire que ça passe inaperçu ? Parce que si Kamto s’est déjà exprimé, je ne vous ai pas vus interagir dessus. Et avant de venir me dire que je me préoccupe de ce que Kamto va dire, commencez d’abord par poster les captures d’écran où vous demandez à ses partisans pourquoi ils se préoccupent autant des prises de parole de Cabral.

Des nuits sans dormir à traiter des PVs pour donner notre vérité au peuple. Prenez une moyenne 3min par PV, le lire, analyser les écarts entre les émargements et les enveloppes retrouvées dans l'urne, repérer les erreurs de calculs, repérer les bourrages etc... Ça fait donc 67 500min de travail effectif soit environ 47 jours de travail. Divisez ça en 5 postes de travail et rajoutez-y la durée des trajets pour acheminer l'ensemble des PVs (certains, notamment dans les zones les plus reculées) n'ayant pas pu envoyer en version digitale). Tenez compte aussi du fait que 58 de nos responsables ont dû prendre part aux commissions départementales ce qui a impacté la main d'œuvre. Mais quand j'ouvre twitter je découvre qu'on fait de la rétention d'informations au profit du RDPC alors même que les témoins vous ont dit ici qu'on l'a combattu dans toutes les commissions allez comprendre ! On avait 28000pvs environ à récupérer on en est à 22500, le PN du @Pcrn_Officiel a instruit de nous arrêter là dans la collecte. D'ici ce soir ou au plus tard demain matin vous aurez la vérité de nos PVs.

🧵1/n Estimating mutation rates using k-mers is fast—but what happens when repeats dominate the genome? In a new preprint, @HaonanWu_1998, Antonio Blanca, and myself propose a *repeat-aware* estimator that's accurate even in centromeres.

(TPCPA), a proteomic resource that provides proteome-scale quantifications of 999 tumors across 22 cancer types in a unified manner, for discovering tumor biology, biomarkers, and therapeutic targets. cell.com/cancer-cell/ab…

Mars: simplifying bioinformatics workflows through a containerized approach to tool integration and management academic.oup.com/bioinformatics… 🧬🖥️🧪 github.com/GenomicAI/mars

wgatools: an ultrafast toolkit for manipulating whole-genome alignments academic.oup.com/bioinformatics… 🧬🖥️🧪 written in Rust github.com/wjwei-handsome…

geneviewer - Gene Cluster Visualizations in R. Imports data from GenBank, FASTA, and GFF files, performs BlastP and MUMmer alignments, and displays results on gene arrow maps. github.com/nvelden/genevi… #Rstats

@nrqa__ Deepseek + 12 prompts to write a book? This is mind-blowing!

xOmicsShiny: an R shiny application for cross-omics data analysis and pathway mapping biorxiv.org/content/10.110… #Rstats 🧬🖥️🧪 github.com/interactiverep…

Some of my favorite books from 2024 (in no particular order): A Brief History of Intelligence by @maxsbennett If you have an interest in evolution, the mind, and artificial intelligence, this one is for you. I would love to take a course based on this book

New year, new assemblies! I'm excited to announce Autocycler, my new tool for consensus assembly of long-read bacterial genomes! It's the successor to Trycycler, designed to be faster and less reliant on user intervention. Check it out: github.com/rrwick/Autocyc… (1/5)

Global trends in antibiotic consumption during 2016–2023 and future projections through 2030 | PNAS pnas.org/doi/10.1073/pn…

New @Nature A mechanism for why durable weight loss is so difficult: epigenetic memory of fat cells nature.com/articles/s4158… @vonMeyenn @laurahinte