Haruo Suzuki

#MetaSUB 国際コンソーシアムでは、都市のマイクロバイオーム #urbanmicrobiome を調査するため、2016年より毎年6月21日（夏至） Global City Sampling Day (gCSD) にサンプリングを実施してきました。 metasub.org/projects/

Our new study maps the urban RNA virome across 2,922 samples, 102 cities and 31 countries. We identified 54,945 RNA viruses, with 77% previously unobserved, and two candidate phyla. Proud to share this work with the @MetaSUB team, @mason_lab and many more! nature.com/articles/s4146…

Molecular biologists are especially interested in domains and motifs with known functions. BAT can highlight user-provided HMM profiles and amino acid motifs (via the ggtree R package) to visualize these features on a gene tree. Domain gain/loss is placed in evolutionary context

インドの大都市における下水中の薬剤耐性のメタゲノムプロファイリング 19地点の下水をメタゲノム解析 微生物多様性、ARGsの拡散、およびMGEsの複雑な相互作用がある 薬剤耐性の拡大抑制に向けた対策のため継続的なサーベイランスが必要 nature.com/articles/s4146…

DiscoVir, an automated pipeline for viral metagenomics, makes viral discovery, taxonomic and functional annotation, host predictions & diversity analyses of the virome easily accessible to researchers at all levels of expertise. Learn more in #MRAJournal: asm.social/2Vx

SFCが環境省の「自然共生サイト」に認定されていることをご存知ですか？ このたび、環境省YouTubeチャンネルにて、SFCの紹介動画がUPされました。ぜひご覧ください！ 自然共生サイト「慶應義塾大学 湘南藤沢キャンパス（SFC）」 youtube.com/watch?v=ViPgpC…

慶應義塾大学湘南藤沢キャンパスの自然共生サイトが環境省のYouTubeチャンネルで紹介されています。研究室の博士課程学生の湯浅君が説明を担当しています。是非ご覧下さい。youtu.be/ViPgpC36X-w?si…

連載コンテンツ「おかしら日記」公開しました 鶴岡で育つ異端の系譜 – 先端生命科学研究所25周年 –｜先端生命科学研究所所長　荒川 和晴 keio.ac.jp/ja/sfc/magazin…

『博士と道化師』鈴木出演回の過去3回が、いずれも10万回再生を超えました🎉 ありがとうございます〜！

おまけ: 4月から大阪大学微生物病研究所で新しく研究室を立ち上げます。宿主遺伝子発現パターンに基づくウイルス探索・性状予測は主要テーマのひとつとして続けていきますので、引き続き注目よろしくお願いします！（16/n） sites.google.com/view/virus-inf…

基礎研究はすぐには役に立たないかもしれない、でも未来を支える大切な活動です。この度、ワクワクする2つの基礎研究を支援するクラファンに挑戦します。テーマは①植物の生存戦略と②デンキウナギの発電器官です。日本の基礎研究を守るため、ぜひ応援・拡散をお願いします。

論文 出た。今の本業では初の論文（末席ですが）。微生物ゲノムからCO2固定経路の有無を予測するツール：A curated resource of chemolithoautotrophic genomes and marker genes for CO₂ fixation pathway prediction. Sci Data 13, 121 (2026). doi.org/10.1038/s41597… pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41673402/

ゲノムアセンブリー間のシンテニー可視化、最近いくつもツールが出ていてどれを使うか迷うので一旦まとめ。

世界的に急拡大している微生物資材は大量の外来微生物を環境中に放出する行為なので、植物や動物で起きたように侵略的外来生物になるリスクがある。が、ほとんど調査・規制されていない。それを防ぐための管理指針を提案　cell.com/trends/microbi… Trends in Microbiol. (2025) 日本でも、農水省から

あれほど福島県の人たちを苦しめたEM菌が、環太平洋国際化学会議2025(Pacifichem 2025)特別イベントになってしまいました。 @breathingpower/p/vvqW1nZ" target="_blank" rel="nofollow noopener">posfie.com/@breathingpowe… 超一流の科学者集団さえ騙してしまうEM菌。 放置すれば日本どころか世界を滅ぼしかねません。 EM菌がニセ科学だということを世界中に知らせたい。

#小松市 の #下水モニタリング 、#インフルエンザ が急増しています。年末年始で人に会う機会も多い時期ですが、みなさんお気をつけください！ city.komatsu.lg.jp/soshiki/1042/s…

New online! Plasmid evolution in the time of antibiotics nature.com/articles/s4157…

この季節になると、企業からやってくる大量の「マイナンバーカードのコピーをおくれ」という依頼に辟易している人いませんか？ 私は（ただでさえ忙しい）この時期に、この依頼が大量に届き始めると「本当にこれマジで何なの？」と思って怒り爆発です！！！ 絶対同じような人多いはず。 中には、両面コピーをとったうえではさみで切って、決められた台紙にのりで貼り付けろという、いきなりの工作指示かよ的なやつさえあります。 色々調べてみますと、源泉徴収や社会保険手続きの際に、事業者側がマイナンバー確認のため、「提出が必ずしも必要ではないケースがある」ことは制度上整理されています。それにもかかわらず、慣習的にマイナンバーの確認をやっている事業者が多すぎるんではないでしょうか。 事業者によって確認の仕方が違うということも、この作業をするフリーランサーや個人に非常に大きな負担となっています。 企業の皆さん、これマジで見直せませんか？？？ 下記のように国税庁から経団連に対して、協力依頼が出ています。経団連も国税庁の話に聞く耳もって、マジでちゃんとこれやってくれー！！！！ keidanren.or.jp/announce/2023/… 賛同してくださる皆さま、拡散をお願いします。 【参考】 （電子情報処理組織を使用して個人番号の提供を受ける場合の本人確認の措置） 第三条 ６　個人番号利用事務等実施者は、本人から個人番号の提供を受ける場合であって、その者と雇用関係にあることその他の事情を勘案し、その者が令第十二条第一項第一号に掲げる書類に記載されている個人識別事項又は第一項各号に掲げる措置により確認される個人識別事項により識別される特定の個人と同一の者であることが明らかであると個人番号利用事務実施者が認める場合には、令第十二条第一項第二号に掲げる書類の提示を受けることを要しない。 （代理人である個人番号提供者を確認できる書類等の提示を受けることが困難であると認められる場合等の本人確認の措置） 第九条 ４　個人番号利用事務等実施者は、本人の代理人から個人番号の提供を受ける場合であって、その者と雇用関係にあることその他の事情を勘案し、その者が令第十二条第二項第一号に掲げる書類に記載されている個人識別事項により識別される特定の個人と同一の者であることが明らかであると個人番号利用事務実施者が認める場合には、令第十二条第二項第二号又は第七条第二項に掲げる書類の提示を受けることを要しない。

「統計・機械学習の数理 Advent Calendar 2025」の、12月6日分の記事を書きました。 明日ちょっと投稿する余裕があるかわからないのでフライング投稿です。 qiita.com/Islay_tr/items…

gffutilsAI: An AI-Agent for Interactive Genomic Feature Exploration in GFF files biorxiv.org/content/10.648…

第20回日本ゲノム微生物学会年会の参加・演題登録を開始いたしました。 年会期間: 2026年3月4日(水)～3月6日(金) 会場: かずさアカデミアホール 事前参加登録期間: 2025年12月1日(月)～2026年2月17日(火) 演題募集期間: 2025年12月1日(月)～2026年1月30日(金) smartconf.jp/content/sgmj26/