Keisuke Kataoka Laboratory（片岡 圭亮 研究室）

分野長の片岡が兼任する慶應義塾大学医学部血液内科学教室の医局説明会のお知らせです。 ★現地・オンラインのハイブリッド開催★ ✅日時： 1回目 = 2026年5月30日（土）15時～ 2回目 = 2026年7月11日（土）15時～ ✅対象：若手医師（専修医・研修医）・医学生 ✅docs.google.com/forms/d/1fBuwA…

当科の佐藤潤医師らによる論文が「Clinical Cancer Research」に掲載されました。進行・再発の固形がん患者を対象とした既承認の類薬が存在しない新規機序の「CLK阻害薬」（ロゴセキブ）のFirst in human （FIH）治験の結果を報告しました。 aacrjournals.org/clincancerres/…

🎉Check out our largest CHIP GWAS to date of >1M participants, shedding light on how germline variation governs which somatic clones in blood expand with aging🧬 In parallel, we conducted CHIP PheWAS, linking CHIP to hematologic, cardiovascular, infectious, and other conditions🩸🫀🦠 medrxiv.org/content/10.110… @M_Mesbah_Uddin @AlexBickMDPhD @pnatarajanmd

1/ Thrilled to share our new paper, out today in @Nature: "Non-invasive profiling of the tumour microenvironment with spatial ecotypes". Paper (open access): nature.com/articles/s4158…

自己免疫性甲状腺疾患では、B細胞に免疫チェックポイント遺伝子（TNFRSF14やCD274など）の体細胞変異が多発し、多様なクローンがポリクローナルに進化することで免疫寛容を回避し、自己反応性の獲得と病態形成に寄与する可能性を示した論文がNature誌に発表されました。 nature.com/articles/s4158…

FIP1L1::PDGFRA & STIL::TAL1, arising from deletions, fusions with low expression levels, and IGH rearrangements (DUX4::IGH, IGH::NSD2) were undetected by multiple algorithms. Compared to conventional RNA-seq, targeted RNA-seq improved the detection sensitivity of driver fusions.

Our paper led by Zen Tamura and @YukiSaito_MDPhD is out in @Nature_NPJ Precision Oncology. Focusing on driver gene fusions in hematologic malignancies, we evaluated 12 fusion detection algorithms using RNA-seq data and found differences in sensitivity. nature.com/articles/s4169…

その中で、①微小欠失によって生じる融合遺伝子（FIP1L1::PDGFRAとSTIL::TAL1）、②発現量の低い融合遺伝子、③IGH再構成（DUX4::IGHなど）は様々なアルゴリズムで見逃されやすいことを示しました。また、標的RNA-seqは通常RNA-seqと比較してドライバー融合遺伝子検出感度が高いことが示されました。

【論文発表】田村全（医学部6年生）、斎藤優樹@YukiSaito_MDPhDらによる論文が@Nature_NPJ Precision Oncologyに掲載されました。細胞株や臨床検体のRNA-seqデータを解析し、造血器腫瘍のドライバー融合遺伝子を対象として12種類の検出アルゴリズムを比較しました。nature.com/articles/s4169…

L1トランスポゾンの活性化が腫瘍細胞で起こり、遺伝子再構成の原因（主として欠失）となっていることは知られていたが詳細は不明だった。腫瘍細胞で長鎖DNA解析によって、L1の活性化が同時に起こって転座を引き起こすなどの現象を確認したという論文。Science誌。science.org/doi/10.1126/sc…

MSK-IMPACT is truly the gift that keeps on giving! Cancer type-specific variation in patterns of driver alterations across 50,000 tumors (!!) cell.com/cancer-cell/fu… "One-third of all drivers arose in non-canonical contexts" Congratulations @MFBerger1 @DSolit & team.

The landscape of structural variation in pediatric cancer cell.com/cancer-cell/fu…

細胞診が「自律化」へ AIと3D光学で臨床レベルの自動診断を実現 新田 尚、合田 圭介 氏らの@Nature #OA #論文 #病理学 Clinical-grade autonomous cytopathology through whole-slide edge tomography nature.com/articles/s4158… #オープンアクセス @kk_cybo @UTokyo_News @WHU_1893 @tohoku_univ @ucla

#拡散希望 文字通り全身全細胞解析を実現した論文がCell誌に掲載。雄と雌の新生仔マウス中の約6.14億と約5.31億の細胞 を観察し、身体の点描画を構築しました。CUBIC論文時(2014年)に着想し10年以上かかりようやく実現。吉田さん・松本さんおめでとう! 大学院生募集中。Ms→sciencedirect.com/science/articl…

Germline haplogroup & somatic loss of Y chromosome (LOY) define risk of human traits🤸‍♂️🧬👋, type 2 diabetes (T2D) in East Asian males. #Singlecell projection of LOY into blood and pancreatic cells. @Go_Sato_UT㊗️ @NatureMedicine #LOY #GWAS #CHIP #diabetes nature.com/articles/s4159…

#気まぐれ論文共有 pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41385760/ pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41428995/ JCO 2025 2本ならんで、リンパ腫に対するリキッドバイオプシーによるMRD評価の論文が掲載されました。 成人の大細胞型B細胞リンパ腫の治療効果の評価には、PETなども使われていますが、まだ精度は十分ではありません。 そこで、 診断時の生検検体などで「腫瘍に特異的な変異」を特定しておきます。 そのうえで、治療後に血液中に流れている腫瘍由来の断片化DNA（cfDNA）を検出しようとしています。つまり、微小な残存病変（MRD）をリキッドバイオプシーで評価する試みです。 結果として、治療終了時にリキッドバイオプシーで陽性の場合はその後の再発率が高いことが示されました。 もちろん、この結果だけで「その段階から治療を追加したら再発を減らすことができる」まではわからないので、今後の治療研究が期待されます。 ちなみに、ゲノムおたく的な補足ですが、このリキッドバイオプシーでは、同一断片に乗っている「phased variants」を標的として検出することで、解析の偽陽性を減らす工夫をしています。なるほど。

TCGAの全ゲノム解読結果を活用して、ゲノム構造多型を再分類した結果、コピー数以上の多くが染色体外DNA（ecDNA）によるものであることなどを明らかにした論文。CELL誌。 cell.com/cell/fulltext/…

The time of day for cancer immunotherapy is associated with major outcomes. Early is better. Results from a randomized trial of lung cancer, backs up the importance of our circadian rhythm and immune system nature.com/articles/s4159…

New @CellCellPress The hallmarks of cancer, refined from the original concepts 25 years ago, as an outgrowth of our expanding knowledge base cell.com/cell/fulltext/…

Online Now: Emerging landscape of KRAS inhibitors in cancer treatment dlvr.it/TQdwB0