ok

@yestefanov В нашем саду тоже все уже выучили пока-пока

@sokrypton I think TMalign actually does find those similarities. It’s undocumented, but worked for me on a real example. Will certainly check out the domains from the paper for my lecture next week on protein structure comparison!

🚨 For those training DL models on proteins, it's possible your "structural" train/test split might have leakage cus tools like foldseek/TMalign (and CATH/SCOP databases) do not always account for structural relationship of circularly permuted proteins:

I am pleased to announce that our latest work on comparative metagenomic analysis of COPD and health control samples has been published today: doi.org/10.3389/fmicb.…. This marks a meaningful milestone in my PhD. Deep thanks to my supervisors @ok55991 and Prof.Dr.Dr Robert Bals.

What an exciting week it's been at the #ISMBECCB2025 conference! The Drug Bioinformatics group had a fantastic presence, with six members presenting their latest work across various COSIs. linkedin.com/feed/update/ur… @nosirrag9 @AnastasiaK15988 @amay_agrawal @JeSuisAlper @ok55991

@yestefanov Это еще ничего - у нас сейчас в ходу слова типа «гу» и «ауа»

@efudgy Почему?

DataSAIL's "press tour" stops @MlcsbC @ISMBinfo in Liverpool for a talk and a poster. If you're in ML, come around and check the data splitting out. I'm looking forward to this and the keynotes by the Nobel Laureates John Jumper and David Baker! @ok55991 @dbblumenthal

@yestefanov Поздравляю!

@not_a_reptiloid По-моему, проблема этой женщины в том, что она - фотошоп

@not_a_reptiloid Все разбирают и частично перерабатывают - Restmüll тоже

@not_a_reptiloid Не стоит. Желтый пакет - это не recyclable мусор, это обычный мусор, только бесплатный. А на мытье ты больше воды и мыла потратишь

@not_a_reptiloid Все валят, и мне пора

@LindorffLarsen @BBKrage I am starting to teach my structural bioinformatics course next week, and I have an idea for an excellent opening slide :D

Excellent planning by @BBKrage on our BSc level Protein Science course Yesterday I was teaching protein structure prediction and tomorrow we will discuss protein design Maybe I should add a new slide

A Perspective from @itisalist @judith_bernett @RomanJoeres @ok55991 @FloHasee @dg_grimm @bit_tumcs & @dbblumenthal discusses the issue of data leakage in machine learning models and presents 7 questions to identify and avoid problems as a result. nature.com/articles/s4159…

@not_a_reptiloid @krbchnk @ed_speedmax Засосало опасное сосало🤣🤣🤣

@not_a_reptiloid Или между гравелом и гравелом) Приезжай, их есть у меня, хотя шоссер старенький

@not_a_reptiloid Между чем и чем? Между разными великами или между контактами и нет? В обоих случаях - да, чувствую, но я не молодой спортивный мужик

@not_a_reptiloid Могу одолжить шоссер - мне кажется, ты по росту подойдешь. Оценишь разницу)

@not_a_reptiloid Бля, ты там и так персональных рекордов понаставил, куда?🤣

@not_a_reptiloid Офигенный результат, ты чо