Saori (Takaoka) Uematsu

【大学院生募集】 データサイエンス技術を用いて、細胞や生体システムの理解・予測・制御に挑戦する大学院生を募集しています。数理モデルや機械学習を活用した生物学・医学研究に関心のある方は、お気軽にご連絡ください。研究室見学・個別相談も随時受け付けています。sites.google.com/view/kkunidalab

翻訳の新常識をテーマとした武田科学振興財団シンポジウムの組織委員長を担当します。早石先生、竹市先生、廣川先生などの先生方が担われてきた歴史あるシンポジウムです。David Baker先生、Jonathan Weissman先生など海外研究者16名が講演予定。ポスター賞あり（最大50万円）。参加登録は6月開始です

凍結組織の免染で、複数の抗体が同じ免疫動物由来であるために共染できず困ったことはありませんか？4i法を改変して凍結組織の多重免疫染色を可能にするCryo-4i法を開発し、プロトコルを公開しました。他の多重免疫染色に比べて【安価・簡単】なのが売りです。 doi.org/10.1016/j.xpro…

Struggling with co-staining in frozen tissue because multiple antibodies share the same host species? We developed Cryo-4i, a modified 4i-based method for simple, cost-effective multiplex immunostaining in frozen tissue. Protocol now available: doi.org/10.1016/j.xpro…

A collaborative work is out! A team with Osamu Takeuchi's lab from Kyoto Univ. and Taku Ito's lab from RIKEN revealed that DHX29 controls codon optimality-mediated mRNA decay. Congratulations, Fabian, Yoshinaga-san, Goto-san, Ito-san, and Takeuchi-sensei! science.org/doi/10.1126/sc…

A new review article is out! This is a wonderful opportunity to exchange ideas with the Tim Stasevich lab (@tim_stasevich) toward the next breakthrough in techniques for studying translation. rnajournal.cshlp.org/content/early/…

Congratulations to Shiying Huang, the lab’s 11th PhD graduate, on passing her @CornellChem B exam today! Check out her recent preprint here: biorxiv.org/content/10.110… So much to celebrate and be thankful for! 🎓🎉

Programmable initiation of mRNA translation by trans-RNA go.nature.com/3K7SEdO

また、来週は引き続き理研セミナーが月曜日と木曜日に開催されます。理研外の方も参加自由・無料ですので、奮ってご参加ください。

本日の理研セミナーに来場いただいた皆様、誠にありがとうございました！とても盛り上がりました。続いて、13日には@usa0ri 博士をお招きしています。みなさまぜひ奮っておこしください！

Our latest paper is out! We reported new mitochondrial Ribo-Seq methods. We truly appreciate the tremendous support from Tom Suzuki lab, Nureki lab, Wei lab, and Tomizawa/Chujo lab @RNAbiker ! cell.com/molecular-cell…

How do cells sense & respond to lipid imbalances? What happens when a disease-relevant enzyme is blocked? Shiying Huang investigates phosphoinositides with the Balla lab & discovers an integrated cellular response boosting synthesis of alternate lipids! biorxiv.org/content/10.110…

本日9月1日より筑波大学医学医療系に教授として着任しました。しばらくは理研に客員として残り、行き来しながらラボ移行を進めていきます。翻訳の時空間制御を一緒に研究しましょう！ （理研のアドレスが使えなくなっていますが転送されますので気にせずメール下さい。筑波のアドレスから返信します）

Our review paper is out from @jbiolchem. We discuss the complex ribosome dynamics during mRNA translation, its regulation, and the cellular consequences. Huge thanks to @shubing_qian and the lab members. jbc.org/article/S0021-…

I'm delighted to share our paper published in @eLife! If you construct many plasmids, SAVEMONEY sequencing is the way to save money. The new version is 20× faster and supports linear DNA and batch processing. Try it out via GoogleColab or PyPI! doi.org/10.7554/eLife.… (1/2)

Delighted to announce that I will be joining the Department of Molecular & Cellular Biology at Harvard University @MCB_Harvard @Harvard as an Assistant Professor this August: mcb.harvard.edu/department/new… The Nagashima lab is interested in immunology, microbiome, and diet. We attempt to understand & engineer T cell response in the gut for developing new therapeutics. We are recruiting ambitious individuals at all levels. So grateful for the support from @mfgrp, and Hiroshi Takayanagi. Many thanks, A. Zhao, K. Atabakhsh, @mTelecasterics, @Sattely_lab, @JamieBlum7, @danmucida, D. Littman, the lab members, and friends for their help!

Our work is out in @Nature! We identified a primed state in G1 phase safeguarding proliferation commitment. Just wanted to deeply thank my mentor Tobias, coauthors, David @cellsarecool1, Nalin @NalinRatnayeke, and Yilin, and the all past and present members of @MeyerTeruelLabs.

オートファゴソーム膜は形成後期に膜が負電荷に変化する, というオートファゴソームの成熟機構論文の最終版が公開されました!足掛け10年((!?)本当にたくさんの方にサポートいただきました. 今後, 成熟機構についての更なる研究の発展を願っています. @MizLabUT で研究できて本当に楽しかったです！

Our preprint is now online @biorxivpreprint @biorxiv_sysbio .The features obtained by tensor decomposition were reflected in the parameters of the biochemical model.

こちらの論文がiScienceからpublishされました。 cell.com/iscience/fullt… また、東大プレリリースも配信されました。 s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/10224/