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@dridk

Médecin biologiste en génétique moléculaire, bioinformaticien et blogueur. #génomique, #bioinformatique, #DataScience @[email protected]

Brest, France Katılım Nisan 2009
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🧬Sacha schutz🧬@dridk·
@BetterCallMedhi Ce qui étonnant, c'est que la mutation est probablement déjà connue ( très peu de mutation sont activatrice ) et ya forcément des scientifiques qui ont déjà testé... Bref, attendons la publication officiel
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🧬Sacha schutz🧬
🧬Sacha schutz🧬@dridk·
@BetterCallMedhi C'est vrai que ça paraît incroyable. En regardant la séquence protéique sur l'article ( blastp ) on peut voir que c'est l'oncogene c-kit. Ça collerait avec la clinique du chien ( une mastocytose ).
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Mehdi (e/λ)
Mehdi (e/λ)@BetterCallMedhi·
bon c’est un truc assez fou mais un mec en Australie vient de concevoir un vaccin ARNm personnalisé contre le cancer pour sauver son chien en utilisant ChatGPT & AlphaFold sachez déjà qu’il a 0 formation en biologie et malgré tout ça ça a marché…la tumeur a réduit de moitié, les chercheurs en génomique sont sous le choc & je pense que cette histoire est infiniment + importante qu’elle en a l’air voilà ce qu’il a fait concrètement il a payé $3000 pour séquencer l’ADN de la tumeur de son chien, il a donné les données à ChatGPT pour identifier les mutations d’intérêt, ensuite il a utilisé AlphaFold pour trouver la structure 3D des protéines mutées & identifier des cibles thérapeutiques, puis il a conçu un vaccin ARNm sur mesure ciblant spécifiquement les néoantigènes de la tumeur…le tout depuis son ordinateur portable mdr le professeur de génomique qui a reçu la demande au départ pensait que c’était une blague, quelques mois + tard il regarde les résultats et dit si on peut faire ça pour un chien pourquoi on le fait pas pour tous les humains atteints de cancer et je pense que c’est là qu’il faut comprendre VÉRITABLEMENT ce qu’AlphaFold représente vraiment (j’ai fait de nombreux threads sur ce programme dans le passé) parce que la plupart des gens en ont entendu parler sans saisir la profondeur de ce qui se passe je vous explique pour ceux qui découvrent le sujet pendant des décennies pour comprendre la structure 3D d’une seule protéine il fallait des mois voire des années de cristallographie aux rayons X ou de cryomicroscopie électronique + des labos entiers mobilisés sur une seule molécule MAIS AlphaFold 2 a résolu ce problème en prédisant la structure de pratiquement toutes les protéines connues soit + de 200 millions de structures, ce qui lui a valu le prix Nobel de chimie 2024 par ailleurs, AlphaFold 3 sorti en 2024 est allé encore +++ loin, là où AlphaFold2 prédisait la structure d’une protéine isolée, AlphaFold 3 prédit les interactions entre protéines, ADN, ARN, petites molécules & ligands dans un système unifié, en gros il modélise comment une molécule médicamenteuse va se fixer sur une protéine cible avec une précision améliorée …et il le fait en quelques heures au lieu de quelques années et c’est exactement ce que ce mec a exploité pour son chien, il a utilisé AlphaFold pour voir la forme 3D des protéines mutées de la tumeur & comprendre comment un vaccin ARNm pourrait apprendre au système immunitaire à les rreconnaître & les détruire d’ailleurs ce qui me fascine c’est ce que ça annonce pour la suite dans la mesure ou isomorphic labs la filiale de Deepmind dédiée à la découverte de médicaments a déj signé des partenariats de plusieurs milliards avec Eli lilly et Novartis, et les premiers médicaments entièrement conçus par IA grâce à AlphaFold 3 devraient entrer en essais cliniques humains prochzinement on parle de candidats en oncologie et en immunologie qui ont été conçus par design rationnel, c’est à dire que l’IA a littéralement dessiné la molécule pour qu’elle se fixe parfaitement sur la cible au lieu de tester des millions de composés au hasard comme on le fait depuis 50 ans!!!!! et le mouvement s’accélère car Deepmind a rendu AlphaFold3 open source fin2024, la communauté scientifique a immédiatement construit dessus, des modèles comme OpenFold3 soutenu par Amazon et Novonordisk, des startups comme Recursion qui développent des versions spécialisées, on entre dans l’ère du «labo autonome » (sujet dont j’ai parlé l’année dernière) où en gros pour vulgariser l’IA conçoit une molécule, des robots la synthétisent et des plateformes de screening la testent sans intervention humaine et je crois que le prochain horizon c’est la modélisation temporelle, aujourd’hui Alphafold prédit la forme statique d’une molécule mais demain on prédira comment elle bouge & vibre au fil du tps à l’intérieur d’une cellule vivante et c’est extrêmement fascinant pour l’avenir! voilà, voilà ;)
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🧬Sacha schutz🧬@dridk·
@BrivaelFr Il faut prendre en compte aussi dans l'équation que Claude code va monter ses tarifs comme jamais une fois que nous serons tous dépendant
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Brivael - FR
Brivael - FR@BrivaelFr·
"Non mais moi l'IA ça me concerne pas, ça fait 20 ans que je fais mon métier" Ok. Laisse-moi t'expliquer ce qui arrive. En ce moment, des gens montent ce qu'on appelle des "AI Agencies". Le concept est simple : Tu prends un expert du domaine (un avocat avec 20 ans de barreau, un comptable senior, un consultant stratégie) + une personne qui maîtrise les systèmes d'IA et sait construire des workflows agentique. À deux, ils construisent une machine qui délivre la même prestation qu'un cabinet de 15 personnes. Même qualité. Même rigueur. Le client ne voit aucune différence dans le livrable. La différence ? Le prix. 10% du tarif actuel. Et souvent, plus rapide. Imagine que la baguette coûte 50€ partout depuis toujours. Tout le monde trouve ça normal, c'est le prix du marché. Et là, quelqu'un débarque avec une baguette à 2€ et elle est aussi bonne, voire meilleure. Tu crois que les gens vont continuer à payer 50€ par fidélité ? C'est exactement ce qui va se passer dans le conseil, le juridique, la compta, l'audit, le design, le développement. Partout où il y a de la prestation intellectuelle facturée à l'heure. Ces agences n'ont pas besoin de 50 salariés. Pas de locaux immenses. Pas de juniors à former pendant 3 ans. Elles ont un expert, des outils, et des systèmes. Et le pire : c'est pas dans 15 ans. Les outils existent aujourd'hui. Les premières agences se montent en ce moment. Le cabinet qui facture 500€ de l'heure pour du travail que deux personnes avec les bons systèmes font en 10 fois moins de temps ne pourra pas tenir. Pas par manque de compétence par impossibilité structurelle de rivaliser sur les coûts. La question n'est plus "est-ce que l'IA va toucher mon métier". C'est : est-ce que tu seras celui qui construit la baguette à 2€, ou celui qui essaie encore de vendre la sienne à 50 ?
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SaxX ¯\_(ツ)_/¯
SaxX ¯\_(ツ)_/¯@_SaxX_·
🚨🔴 Les USA ont utilisé Claude, quelques heures seulement après son interdiction par le président Trump, pour les frappes contre l'Iran Claude d'Anthropic ! Des révélations du Wall Sreet Journal où l'on apprend que : > Le Commandement central américain au Moyen-Orient a utilisé Claude à des fins de renseignement > Claude a été utilisé pour évaluer les renseignements collectés, identifier des cibles et simuler des scénarios tactiques de batailles > Le gouvernement américain dit que l'élimination progressive d'un Claude prendra 6 mois ; après le bras de fer entre le Pentagone et Anthropic (l'entreprise qui développe l'IA) dont je vous parlais en début de semaine > Une utilisation similaire des renseignements a été observée lors de la capture du président vénézuélien, Nícolas Maduro On assiste au début d'une nouvelle guerre boostée par de l'Intelligence Artificielle... 🤯 MAKE NO MISTAKES
SaxX ¯\_(ツ)_/¯ tweet media
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zkespresso
zkespresso@zkespresso·
@dridk @_SaxX_ T'as pas répondu sous le bon post je pense, le mien c'était le communiqué de presse
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SaxX ¯\_(ツ)_/¯
SaxX ¯\_(ツ)_/¯@_SaxX_·
Cyberattaque Cegedim (Mon Logiciel Medical) : Des données de Santé extrêmement sensibles dans les commentaires (à la.discrétion du médecin) sur les patients font froid dans le dos... 👉🏾 "4 ans attouchement à 7 ans avec le fils de la nourrice tentative de vi*l à 20 ans dépression 90" 👉🏾 "Homoséxualité, vi*l en 2010 bilan RAS à l'époque" 👉🏾 "origine chilienne [...] boulimie actuelle , dépressive (pb psy = suite de harcellement s*xuel avec tentative de vi*l à 4-5 ans" 👉🏾 "déprime ++ suite de vi*l de sa fille" On découvre l'historique médical de certains patients sur de nombreuses années...
SaxX ¯\_(ツ)_/¯ tweet media
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zkespresso
zkespresso@zkespresso·
Communiqué de Cegedim "Cegedim déplore cette situation et a pleinement conscience du désagrément que cet incident peut susciter." TLDR: Ils s'en foutent et n'auront pas de sanctions. Il est temps de changer cette administration qui ne sévit jamais face à de telles incompétences. La Cybersécurité doit être un point crucial dans les programmes de 2027.
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Bo Xia
Bo Xia@BoXia7·
Here is the transcriptomics insight: the bulk RNA-seq (Fig 1), single-cell RNA-seq (Fig. 2), spatial transcriptomics (Fig. 3), and the original organ (Fig. 4). (Feel free to cite with image credit to Bo Xia)
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🧬Sacha schutz🧬@dridk·
@GregSacco75 @michel_paulin Non. Ce sont des logiciels libres et donc: - Bcp + de développeurs que dans le privé. Suffit de regarder sur github grist/superset/jitsi. - Les outils sont gratuit pour les organismes publique. - Le privé peut contribuer à ces outils contre une rémunération.
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🇫🇷 Gregory Saccomani 🇮🇹
.@michel_paulin (ex-OVHcloud) qualifie d’"hérésie" le fait que l’État développe sa propre alternative à Teams/Zoom. Franchement : il a raison ! Ce n’est pas le rôle de l’État de refaire des produits que le marché maîtrise déjà. 👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇 bfmtv.com/economie/c-est…
🇫🇷 Gregory Saccomani 🇮🇹 tweet media
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🧬Sacha schutz🧬@dridk·
@BetterCallMedhi Je pense que dans le futur, nous aurons une révolution technologique où nous pourrons construire des objets biologiques par ingénierie génétique. Par exemple des vêtements qui se réparent en cicatrisant...
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Mehdi (e/λ)
Mehdi (e/λ)@BetterCallMedhi·
à chaque jour sa dinguerie mais depuis un bon moment maintenant y’a tellement de dingueries annoncées chaque jour que je n’ai littéralement pas le temps de tout décrypter pour vous expliquer tout ce qui se passe je vais quand même prendre le temps de vous parler de cette annonce que je trouve juste fantastique dans la mesure où DeepMind vient de rendre AlphaGenome accessible mondialement & c’est un game changer sachez que ce modèle analyse jusqu’à 1 million de paires de bases d’ADN et prédit comment une seule mutation (1 seul nucléotide changé) peut complètement bouleverser l’expression de milliers de gènes simultanément & il écrase littéralement tous les modèles existants pour info vous pouvez maintenant diagnostiquer des maladies génétiques ultra rares en identifiant exactement quelle mutation cause le phénotype, designer computationnellement des thérapies géniques optimisées avant même de synthétiser l’ADN (et ça c’est FORT, TRÈS FORT) & même découvrir les mutations driver du cancer pour des traitements personnalisés au patient pour que vous compreniez tous ce qui se passe ici, on vient en gros de passer de séquencer l’ADN & espérer comprendre ce qu’il fait à prédire l’impact fonctionnel exact de chaque mutation avant même de toucher une seule pipette je crois que la médecine génomique de précision vient de basculer profondément dans l’ère computationnelle & les fondateurs qui intègrent dès maintenant cette infrastructure ne vont pas simplement construire que des produits ils vont JUSTE construire des géants biotech qui vont réécrire la médecine pour les 50 PROCHAINES ANNÉES ce qui est incroyable c’est qu’on en train de transformer le code génétique d’un mystère biologique en langage de programmation déchiffrable & surtout modifiable & en ce sens le futur que se construit dépasse TRÈS LARGEMENT la science fiction puisque les opportunités qui souvent sont juste ÉNORMES PARTOUT DANS LE MONDE puisque je vous rappelle que ce modèle est maintenant distribue distribué à l’échelle globale bref je vais sûrement me répéter mais restez extrêmement CURIEUX car c’est bien votre curiosité inée qui vous empêchera de tomber dans l’obsolescence face à un raz de marée d’innovations dans tous domaines des biotech au quantique en passant par la robotique industrielle & que je prends un plaisir à vous partager régulièrement ici
Google DeepMind@GoogleDeepMind

Our breakthrough AI model AlphaGenome is helping scientists understand our DNA, predict the molecular impact of genetic changes, and drive new biological discoveries. 🧬 Find out more in @Naturegoo.gle/4bXlV6y

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La Tronche en Biais
La Tronche en Biais@TroncheBiais·
J'eus été presque déçu si aucun platiste n'avait réagi à la vidéo qui raconte l'exploit expérimental d'Ératosthène qui a mesuré la Terre sans quitter le sol. En -240.
La Tronche en Biais tweet media
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Hamza Khalid
Hamza Khalid@Whizz_ai·
Google literally published a 69-page prompt engineering masterclass ♻️ Repost and Comment "Course" for Instant DM.
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SaxX ¯\_(ツ)_/¯
SaxX ¯\_(ツ)_/¯@_SaxX_·
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Andhy… Anything Else
Andhy… Anything Else@WarolADD·
@CharretChristo1 Commençons par dire que cette observation a été faite sur un œuf d'étoile de mer. Selon les chercheurs, les ondes sont créées par des milliards de protéines activées qui traversent la membrane de l'œuf, ce qui lui signale de commencer le processus de division cellulaire.
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Tommy. T
Tommy. T@tallmetommy·
Text alone will never be human-level intelligence. But text was never the substrate. It’s the interface. Human intelligence emerges from: • grounded world models • continuous prediction • error-driven learning • embodiment and feedback • memory across time • self-correction under constraint So here’s the truth of how we get there: We stop training models to imitate language and start training systems to predict reality. The path is not more tokens. It’s multi-modal world modeling + continuous self-supervised learning. Concretely: • Vision, audio, action, time, and consequence are trained jointly • The system learns what changes when it acts • Memory persists across episodes, not prompts • Goals are internal, not user-injected • Language becomes a read/write layer on top of a latent world model This is how infants learn. This is how control systems work. This is how intelligence scales. Text-only models plateau because symbols without grounding collapse into correlation. Grounded models compound because prediction errors teach causality. AGI won’t arrive as a chatbot breakthrough. It will arrive as a world simulator that happens to speak. And once you see it that way, the path is obvious, testable, and already underway. 🦾
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Sebastian Seung
Sebastian Seung@SebastianSeung·
Question for all you AI and brain lovers! Which of these brains has the same size as the most advanced LLMs today? Mouse, monkey, or human? (Compare model sizes please.) HT @suzanahh
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alphaXiv
alphaXiv@askalphaxiv·
Attention Is Not What You Need This paper replaces self-attention with Grassmann Flows: a linear-time sequential model based on low-rank geometric flows on a Grassmann manifold. Early results show competitive performance with Transformers, with potentially better scaling and a more interpretable mathematical structure.
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🧬Sacha schutz🧬@dridk·
@_SaxX_ Avec toutes ces données individuelles qui fuitent, existe il maintenant une giga base de données unique qui agrege tout avec l'identifiant d'un individu comme clef primaires ?
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SaxX ¯\_(ツ)_/¯
SaxX ¯\_(ツ)_/¯@_SaxX_·
🚨🔴CYBERALERT 🇫🇷FRANCE🔴 | Mondial Relay et Colis Privé piratés... Au total 25M de données personnelles dans les mains de cybercriminels... ⤵️ Vivement que 2025 se termine... JPP ! Encore une nouvelle cyberattaque sur 2 géants de la livraison à domicile et en point relais... Mondial Relay et Colis Privé ! Le groupe cybercriminel Dumpsec a revendiqué la cyberattaque avec preuves à l'appui sur le nouveau amazon de la cybercriminalité. En leur possession, +25M de données personnelles piratées en novembre : 👉🏾 nom, 👉🏾 prénom, 👉🏾 adresse email, 👉🏾 adresse postale, 👉🏾 numéro de téléphone, 👉🏾 informations nécessaires au suivi logistique des colis : numéro d'expédition et de commande, statuts de livraison détaillés. Le pire... la plateforme n'a détectée la cyberattaque que des semaines après et depuis hier, elle alerte des millions de français ! Pour info, il y a quelques jours un accès direct en ligne était encore proposé à la vente... c'est comme si vous étiez dans toute la base de données Mondial Relay et pouviez faire vos recherches comme bon vous semblez... 5000€, c'était le prix ! Je vous révélerai d'autres infos sur les coulisses de cette nouvelle cyberattaque hors-norme ! Ça ne sert plus à rien de suivre les conseils cyber d'experts comme moi ou d'autres experts Français... à chercher à protéger votre vie privée numérique ! Les entreprises, le gouvernement, nos institutions ont vraiment échoué ! Pire encore, ils piétinent et baffouent nos libertés individuelles ! Comme dirait Nicolas Ruff, LA CYBERSÉCURITÉ EST UN ÉCHEC ! Désormais, en cette fin 2025, je rajoute aussi que LE RGPD EST UN ÉCHEC ! FAUDRA SE SORTIR LES DOIGTS TRÈS RAPIDEMENT EN 2026... Je suis dépité ! Dégouté ! Atterré ! Affligé ! ... On est le pays en Europe qui s'est fait le plus défoncé niveau fuites de données. Faudrait que je regarde niveau monde on est comment aussi. [...] Vivement 2026... Cybèrement vôtre, SaxX ¯\_(ツ)_/¯
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